More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4837 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4837  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 510 aa  988    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0342073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2774  FAD dependent oxidoreductase  56.7 
 
 		 519 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.986908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3759  FAD dependent oxidoreductase  56.95 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12278  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD1  56.58 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3372  FAD dependent oxidoreductase  58.55 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.581331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3383  FAD dependent oxidoreductase  58.55 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3434  FAD dependent oxidoreductase  58.55 
 
 		 518 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1956  FAD dependent oxidoreductase  56.8 
 
 		 520 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5601  FAD dependent oxidoreductase  52.55 
 
 		 538 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340972  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33290  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  52.76 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.954815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1796  FAD dependent oxidoreductase  53.58 
 
 		 518 aa  405  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00246275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  50.78 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2773  FAD dependent oxidoreductase  52.5 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114338  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0304  FAD dependent oxidoreductase  52.85 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0184959  normal  0.333505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6684  FAD dependent oxidoreductase  49.57 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.414435  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2239  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50.62 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.126564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4592  FAD dependent oxidoreductase  48.87 
 
 		 523 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00758706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5410  FAD dependent oxidoreductase  48.59 
 
 		 529 aa  362  8e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0941  FAD dependent oxidoreductase  51.06 
 
 		 555 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0194279  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 572 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 		 574 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 		 560 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.11 
 
 		 585 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  37.88 
 
 		 603 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 600 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 524 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 582 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 		 559 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.24 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.14 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 582 aa  240  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  36.59 
 
 		 559 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 		 542 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 577 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 583 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 		 579 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  38.05 
 
 		 582 aa  233  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  39.65 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.97 
 
 		 554 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 536 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 552 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 		 573 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  37.6 
 
 		 559 aa  230  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 525 aa  229  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  37.67 
 
 		 579 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 		 639 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  39.81 
 
 		 605 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 573 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 546 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 578 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 		 603 aa  226  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 574 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 		 568 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 567 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  34.45 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  37.98 
 
 		 569 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.39 
 
 		 591 aa  223  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 584 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 		 566 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.14 
 
 		 567 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.57 
 
 		 587 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 		 575 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 583 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 582 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 		 557 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 537 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 595 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  36.67 
 
 		 585 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  31.93 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 576 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 533 aa  210  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 529 aa  210  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 532 aa  210  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 532 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  36.31 
 
 		 602 aa  206  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 518 aa  206  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 539 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 567 aa  204  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 581 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  40.2 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  35.98 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.93 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 579 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 579 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.93 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 519 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 556 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>