More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4769 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 590 aa  1179    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  40.23 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.83 
 
 		 328 aa  260  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  46.62 
 
 		 389 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5268  DNA polymerase III subunit epsilon  42 
 
 		 330 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.674728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  41.67 
 
 		 330 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4989  DNA polymerase III subunit epsilon  41.67 
 
 		 330 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  39.6 
 
 		 345 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  38.33 
 
 		 333 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13743  DNA polymerase III subunit epsilon  38.93 
 
 		 329 aa  194  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000832595  normal  0.511972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.89 
 
 		 224 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5482  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.75 
 
 		 193 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.915048 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5882  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.75 
 
 		 193 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  40.65 
 
 		 689 aa  110  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  37.5 
 
 		 289 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  32.18 
 
 		 433 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  36.09 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  40.41 
 
 		 401 aa  100  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  34.29 
 
 		 722 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.53 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  32.63 
 
 		 191 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2129  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.42 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  41.46 
 
 		 407 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  31.71 
 
 		 1449 aa  94.4  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  33.14 
 
 		 1447 aa  94  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  32.95 
 
 		 191 aa  94  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  31.71 
 
 		 1449 aa  94  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  33.91 
 
 		 449 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  33.53 
 
 		 191 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.98 
 
 		 595 aa  92  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  35.71 
 
 		 191 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  38.57 
 
 		 437 aa  91.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 		 476 aa  90.5  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  33.72 
 
 		 191 aa  90.1  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  33.72 
 
 		 191 aa  90.1  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  28.49 
 
 		 428 aa  90.1  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2943  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.73 
 
 		 410 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000266032  decreased coverage  0.0000042458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  35.67 
 
 		 530 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7047  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  47.86 
 
 		 382 aa  87.8  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.85 
 
 		 530 aa  87.4  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  31.43 
 
 		 578 aa  87.4  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  31.03 
 
 		 1402 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  33.55 
 
 		 191 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3810  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.98 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  34.1 
 
 		 1440 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.26 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  32.89 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  36.99 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  33.73 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  34.04 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  34.21 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  34.04 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  34.04 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  32.9 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  28.65 
 
 		 1397 aa  84  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  32.37 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  32.18 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  29.17 
 
 		 1527 aa  83.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3719  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 		 315 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 		 315 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.53 
 
 		 610 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  31.55 
 
 		 191 aa  83.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.02 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 		 315 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  32.93 
 
 		 191 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  33.93 
 
 		 191 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  34.87 
 
 		 192 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  33.53 
 
 		 191 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.73 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  30 
 
 		 192 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  33.93 
 
 		 191 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.49 
 
 		 1433 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  34.87 
 
 		 192 aa  82.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  32.74 
 
 		 205 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  27.91 
 
 		 1407 aa  82  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  33.33 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  30.06 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1597  DNA polymerase III subunit epsilon  32.93 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0450283  hitchhiker  0.0000576312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  28.74 
 
 		 1442 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  36.36 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  33.09 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  31.11 
 
 		 1421 aa  81.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  33.57 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3297  DNA polymerase III subunit epsilon  32.34 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  30.54 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  32.14 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  32.74 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02830  hypothetical protein  31.61 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  34.94 
 
 		 617 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  30.86 
 
 		 217 aa  80.1  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9062  DNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 189 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  28.95 
 
 		 192 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  31.43 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  31.69 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  30.06 
 
 		 192 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  28.88 
 
 		 192 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>