More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4364 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4364  luciferase-like protein  100 
 
 
291 aa  579  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.390419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3922  luciferase family protein  72.51 
 
 
293 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3907  luciferase-like protein  72.16 
 
 
293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3981  luciferase family protein  72.16 
 
 
293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.389653  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4383  luciferase family protein  70.1 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.722636  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2283  luciferase family protein  68.58 
 
 
296 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.645875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4152  hypothetical protein  54.92 
 
 
201 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.260542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7375  Luciferase-like monooxygenase  33.91 
 
 
282 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.758616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3229  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.01 
 
 
293 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.20707  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4141  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.71 
 
 
285 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  0.0129648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.38 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3175  Luciferase-like monooxygenase  38.1 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6834  luciferase family protein  38.52 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2521  luciferase-like monooxygenase  33.75 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00896395  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8869  Luciferase-like monooxygenase  30.71 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0282  luciferase family protein  32.95 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0291  luciferase-like protein  32.95 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0301  luciferase family protein  32.95 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  38.46 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  34.48 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  30.18 
 
 
343 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  29.58 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3595  luciferase family protein  39.56 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26001  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2017  luciferase family protein  31.54 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  27.69 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4740  Luciferase-like monooxygenase  31.87 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.95 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  32.3 
 
 
341 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  26.71 
 
 
322 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2071  luciferase-like protein  34.35 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798255  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  35.25 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  34.75 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  36 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  34.75 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  34.75 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2912  luciferase family protein  38.46 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122178  normal  0.460914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  37.63 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  35.29 
 
 
339 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  26.83 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2788  Luciferase-like monooxygenase  29.13 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  33.33 
 
 
337 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  29.66 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  29.55 
 
 
309 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  35.56 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  31.72 
 
 
346 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1419  Luciferase-like monooxygenase  36.17 
 
 
293 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.08 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  35.25 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.08 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  41.35 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3326  luciferase-like protein  37.08 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1970  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.06 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4131  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.23 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  0.0404326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  34.19 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  37.5 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3388  Fis family transcriptional regulator  37.08 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.695689  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3337  Fis family transcriptional regulator  37.08 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122332  normal  0.403039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2877  luciferase-like protein  41.94 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.65 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2907  luciferase family protein  41.94 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0407498  normal  0.486218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  29.58 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0532  luciferase-like protein  27.56 
 
 
346 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3514  Luciferase-like monooxygenase  37.29 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.11 
 
 
313 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  27.32 
 
 
288 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4839  luciferase family protein  32.17 
 
 
272 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4198  Luciferase-like monooxygenase  37.89 
 
 
376 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4238  luciferase family protein  36 
 
 
345 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140286  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  28.49 
 
 
382 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  27.91 
 
 
353 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  30.38 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  34.24 
 
 
290 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  30.08 
 
 
328 aa  59.7  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4901  luciferase family protein  41.94 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  33.33 
 
 
293 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2921  luciferase family protein  41.94 
 
 
351 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  35.62 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  33.33 
 
 
338 aa  59.7  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2107  Luciferase-like monooxygenase  30.94 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  31.37 
 
 
281 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.29 
 
 
734 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.39 
 
 
282 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  27.56 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
327 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0958  luciferase-like  33.59 
 
 
361 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  33.12 
 
 
341 aa  58.9  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.96 
 
 
365 aa  58.9  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  33.7 
 
 
282 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1301  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.350981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0161  luciferase-like  35.71 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0029  Luciferase-like monooxygenase  36.19 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1816  luciferase family protein  35.04 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00324647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  30.65 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4138  luciferase-like protein  34.86 
 
 
353 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4569  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.76 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.658744  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.05 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3525  Luciferase-like monooxygenase  40 
 
 
291 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011869  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0027  Luciferase-like monooxygenase  37.14 
 
 
345 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.15 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>