More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4020 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 317 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  59.94 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  63.99 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  60.44 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.44 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  62.5 
 
 		 322 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  58.17 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  58.06 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  58.88 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.75 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.85 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.3 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.47 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.66 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.97 
 
 		 344 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.96 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  49.03 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.28 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.17 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  50.64 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 		 595 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.32 
 
 		 335 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.25 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.81 
 
 		 339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.01 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.67 
 
 		 351 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.59 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.35 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.46 
 
 		 333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.55 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.99 
 
 		 608 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.37 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.93 
 
 		 398 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.13 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.31 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.46 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.71 
 
 		 471 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.29 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.29 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.71 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  34.52 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.1 
 
 		 476 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  32.64 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  32.64 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.64 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  32.64 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.77 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.78 
 
 		 417 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1914  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.15 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.02 
 
 		 455 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  37.05 
 
 		 444 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  32.64 
 
 		 476 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.54 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3547  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.32 
 
 		 462 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.4 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  31.82 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.82 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.13 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.68 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  39.91 
 
 		 442 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  35.64 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  29.41 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.58 
 
 		 436 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  32.12 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3147  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.96 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.23 
 
 		 464 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  31.82 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01210  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.76 
 
 		 394 aa  99.8  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.92 
 
 		 509 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1467  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0235653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.4 
 
 		 682 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.81 
 
 		 440 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.71 
 
 		 451 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1084  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.71 
 
 		 460 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.43 
 
 		 324 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0175  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  32.98 
 
 		 535 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3417  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.71 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0934  cell-cycle protein  28.3 
 
 		 427 aa  97.4  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.504247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.1 
 
 		 476 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.75 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.26 
 
 		 457 aa  96.7  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.44 
 
 		 485 aa  96.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.21 
 
 		 486 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.78 
 
 		 456 aa  96.3  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  31.2 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.58 
 
 		 433 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.62 
 
 		 472 aa  95.9  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.78 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03220  hypothetical protein  30.18 
 
 		 448 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.22 
 
 		 464 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.94 
 
 		 476 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.51 
 
 		 469 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17771  ATPase  31.48 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0884418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.22 
 
 		 464 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.32 
 
 		 464 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.18 
 
 		 469 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.1 
 
 		 481 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.03 
 
 		 473 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1980  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.03 
 
 		 468 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>