More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0074 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  100 
 
 		 337 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  60.83 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  50.29 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17771  ATPase  45.34 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0884418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18411  ATPase  34.44 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18601  ATPase  33.84 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.101709  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1743  hypothetical protein  32.84 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21191  ATPase  35.8 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18411  ATPase  34.44 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1249  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.11 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  41.03 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.46 
 
 		 324 aa  162  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.02 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.06 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.26 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.72 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.81 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  40.26 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.61 
 
 		 464 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.75 
 
 		 464 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  28.16 
 
 		 476 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.16 
 
 		 476 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  28.16 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.65 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  27.83 
 
 		 476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  27.83 
 
 		 476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  27.18 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.18 
 
 		 476 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.83 
 
 		 476 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.51 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.1 
 
 		 462 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.89 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.85 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.31 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.72 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.62 
 
 		 486 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.39 
 
 		 509 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  27.76 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.18 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  29.97 
 
 		 458 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.38 
 
 		 524 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.21 
 
 		 476 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  29 
 
 		 470 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.7 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.75 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  34.1 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.1 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.78 
 
 		 455 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  32.73 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.28 
 
 		 339 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.83 
 
 		 470 aa  97.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.53 
 
 		 423 aa  97.1  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  31.44 
 
 		 476 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.96 
 
 		 324 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  34.6 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.59 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.2 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 		 595 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0626  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.86 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  27.89 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.89 
 
 		 449 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.83 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.33 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.47 
 
 		 372 aa  93.2  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.98 
 
 		 454 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  35.78 
 
 		 471 aa  92.8  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  34.18 
 
 		 444 aa  92.8  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.26 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.85 
 
 		 445 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.56 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.56 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.91 
 
 		 469 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.39 
 
 		 469 aa  89.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0016  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  27.15 
 
 		 422 aa  89.4  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0228  MesJ/Ycf62 family protein  28.8 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.08 
 
 		 456 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.91 
 
 		 442 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1815  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.7 
 
 		 450 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.195712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  29.23 
 
 		 425 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0437  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.32 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.15 
 
 		 457 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0175  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.26 
 
 		 535 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.72 
 
 		 521 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.88 
 
 		 419 aa  87.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0541  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.38 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41194  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  33.01 
 
 		 454 aa  86.7  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 		 608 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.61 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.88 
 
 		 455 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.49 
 
 		 476 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.08 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0164  hypothetical protein  30.22 
 
 		 525 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.156481  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  29.35 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.07 
 
 		 430 aa  85.9  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5490  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.32 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0589  cell cycle protein MesJ  32.97 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0620316  normal  0.254248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2960  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.32 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  31.5 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.32 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0275  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  27.47 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.538522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>