More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
324 aa  623  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  61.82 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.93 
 
 
320 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.86 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  61.43 
 
 
322 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  60.93 
 
 
320 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.93 
 
 
320 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  59.86 
 
 
323 aa  242  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.48 
 
 
358 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  55.88 
 
 
312 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.96 
 
 
334 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  62.72 
 
 
308 aa  222  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.37 
 
 
325 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.36 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.8 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.47 
 
 
334 aa  205  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  51.37 
 
 
337 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  51.19 
 
 
324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.9 
 
 
344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.57 
 
 
339 aa  195  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.35 
 
 
333 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.97 
 
 
344 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.5 
 
 
335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.69 
 
 
372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.46 
 
 
376 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.53 
 
 
333 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.71 
 
 
351 aa  164  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
608 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.67 
 
 
364 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.12 
 
 
388 aa  152  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.35 
 
 
595 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.76 
 
 
386 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.67 
 
 
324 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.65 
 
 
356 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.66 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.69 
 
 
468 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.33 
 
 
471 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.55 
 
 
326 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2989  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.2 
 
 
384 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  29.58 
 
 
449 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.58 
 
 
449 aa  122  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.51 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.49 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.83 
 
 
345 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  33.43 
 
 
458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  36.99 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.11 
 
 
455 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17771  ATPase  32.14 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0884418  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  31.65 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.48 
 
 
464 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.48 
 
 
464 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.62 
 
 
476 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.47 
 
 
456 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  35.66 
 
 
337 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  35.71 
 
 
442 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  28.71 
 
 
476 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  37.66 
 
 
334 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.25 
 
 
436 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  28.71 
 
 
476 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.04 
 
 
473 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  28.71 
 
 
476 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.71 
 
 
476 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  36.47 
 
 
445 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.27 
 
 
324 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.08 
 
 
426 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  28.39 
 
 
476 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  31.37 
 
 
342 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.46 
 
 
427 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.07 
 
 
470 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1478  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.7 
 
 
418 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.73 
 
 
476 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  28.08 
 
 
476 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.41 
 
 
476 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.47 
 
 
323 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.08 
 
 
476 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.75 
 
 
417 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1364  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.55 
 
 
465 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.79 
 
 
455 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1249  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  25.24 
 
 
326 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21191  ATPase  24.92 
 
 
326 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.1 
 
 
486 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  31.1 
 
 
476 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.14 
 
 
472 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.04 
 
 
439 aa  99.8  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.62 
 
 
474 aa  99.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.39 
 
 
433 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  30.22 
 
 
443 aa  99.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.79 
 
 
458 aa  99.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  37.34 
 
 
444 aa  99.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30 
 
 
509 aa  99.4  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0959  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.11 
 
 
425 aa  99  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3147  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.97 
 
 
442 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.88 
 
 
464 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0689  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.6 
 
 
409 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.32 
 
 
476 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.12 
 
 
462 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0175  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.58 
 
 
535 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.66 
 
 
476 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
676 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  31.91 
 
 
470 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>