More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4968 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 334 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  62.84 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.76 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  57.88 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  61.9 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  54.93 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.51 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.94 
 
 		 321 aa  248  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.59 
 
 		 341 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.97 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.57 
 
 		 595 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.91 
 
 		 608 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.05 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.34 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.09 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.55 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.63 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.5 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.99 
 
 		 344 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.47 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.77 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.42 
 
 		 351 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.38 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.49 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.7 
 
 		 317 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  55.59 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.8 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.15 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.67 
 
 		 330 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2989  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.06 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  45.57 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  46.46 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.46 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.85 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.4 
 
 		 334 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  57.73 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.23 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.98 
 
 		 324 aa  132  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.77 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.02 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  31.83 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  35.33 
 
 		 468 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01210  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.92 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.22 
 
 		 470 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.43 
 
 		 455 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  38.85 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.37 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.51 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.36 
 
 		 509 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.52 
 
 		 442 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  32.42 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.48 
 
 		 472 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  43.33 
 
 		 430 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.23 
 
 		 485 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  40.38 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.94 
 
 		 473 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.62 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.62 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1461  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.17 
 
 		 491 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  32.09 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.46 
 
 		 455 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.39 
 
 		 455 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.08 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.33 
 
 		 521 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1497  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.73 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.81 
 
 		 417 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.38 
 
 		 445 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  39.08 
 
 		 442 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1466  Fis family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.03 
 
 		 472 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2886  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.87 
 
 		 496 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664509  normal  0.0502291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  37.08 
 
 		 445 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  38.75 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.74 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.89 
 
 		 436 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  27.6 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.6 
 
 		 449 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.6 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1263  PP-loop  32.38 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.4 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.44 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000332242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3547  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.97 
 
 		 427 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  32.93 
 
 		 343 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.77 
 
 		 336 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.66 
 
 		 456 aa  99.4  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.48 
 
 		 457 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.64 
 
 		 462 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0164  hypothetical protein  36.06 
 
 		 525 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.156481  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.38 
 
 		 476 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.11 
 
 		 459 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.73 
 
 		 524 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.06 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0977  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.68 
 
 		 438 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  39.08 
 
 		 371 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 682 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.12 
 
 		 469 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1316  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.83 
 
 		 346 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.51 
 
 		 451 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  35.59 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.98 
 
 		 436 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.934648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>