More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2997 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 323 aa  662    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  68.45 
 
 		 326 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  67.82 
 
 		 326 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  59.94 
 
 		 324 aa  378  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  56.21 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  55.25 
 
 		 336 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.84 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  46.44 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17771  ATPase  39.15 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0884418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1743  hypothetical protein  33.55 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  36.06 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.82 
 
 		 471 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18601  ATPase  31.43 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.101709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18411  ATPase  32.53 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18411  ATPase  31.04 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  35.86 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.76 
 
 		 472 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  34.38 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1249  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.38 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21191  ATPase  40.28 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.03 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  35.67 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.64 
 
 		 456 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.41 
 
 		 472 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.53 
 
 		 470 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36 
 
 		 454 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.6 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  30.84 
 
 		 470 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.49 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.66 
 
 		 468 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.6 
 
 		 464 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.8 
 
 		 480 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.13 
 
 		 485 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  31.82 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.17 
 
 		 469 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.75 
 
 		 468 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.2 
 
 		 442 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.16 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.42 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.12 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.48 
 
 		 473 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  29.29 
 
 		 458 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.35 
 
 		 458 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.89 
 
 		 457 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.47 
 
 		 457 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.16 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.34 
 
 		 414 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.08 
 
 		 464 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.31 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.76 
 
 		 474 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0622  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.03 
 
 		 456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.336141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  33.19 
 
 		 471 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.58 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  28.41 
 
 		 476 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0704  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.37 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  28.41 
 
 		 476 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.42 
 
 		 486 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.41 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  28.41 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.68 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.89 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.66 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.88 
 
 		 476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 682 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  30.13 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  31.58 
 
 		 449 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.58 
 
 		 449 aa  113  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.51 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 676 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  27.31 
 
 		 476 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.31 
 
 		 476 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.41 
 
 		 476 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  28.41 
 
 		 476 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.13 
 
 		 455 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.98 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.41 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0494  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32 
 
 		 465 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.49 
 
 		 241 aa  110  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.65 
 
 		 476 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000332242  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0631  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.79 
 
 		 397 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.3 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  28.05 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0626  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.71 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  31.14 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.04 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.73 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.33 
 
 		 459 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.48 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0012  putative cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family  28.57 
 
 		 421 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.3 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.1 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5217  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.57 
 
 		 444 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.02 
 
 		 450 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0872  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.14 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.59 
 
 		 339 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.88 
 
 		 372 aa  105  7e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.95 
 
 		 455 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.58 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.58 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 608 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>