More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0555 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 312 aa  585  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  62.97 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.13 
 
 		 323 aa  278  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  58.42 
 
 		 317 aa  262  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  59.31 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  58.68 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  58.68 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.21 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  56.69 
 
 		 323 aa  235  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.88 
 
 		 358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.84 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  63.1 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.1 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.29 
 
 		 325 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.62 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.65 
 
 		 321 aa  198  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  50.48 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  49.85 
 
 		 337 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.77 
 
 		 376 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  54.33 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.62 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.67 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.47 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.17 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.15 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 		 595 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  57.53 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.87 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.69 
 
 		 333 aa  148  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.72 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.12 
 
 		 372 aa  145  9e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 		 608 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.43 
 
 		 386 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.77 
 
 		 398 aa  132  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.03 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2989  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.07 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.62 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.68 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.68 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.32 
 
 		 468 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  38.43 
 
 		 444 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.79 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17771  ATPase  32.73 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0884418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.5 
 
 		 455 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.69 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  35.74 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  29.43 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  29.43 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  29.43 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  30.29 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.43 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.14 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.7 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.03 
 
 		 476 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  39.21 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.76 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.74 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  44.9 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  32.88 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.36 
 
 		 436 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  29.1 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1467  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.55 
 
 		 338 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0235653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.01 
 
 		 470 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.62 
 
 		 524 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.83 
 
 		 476 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  31.35 
 
 		 343 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  38 
 
 		 425 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.76 
 
 		 476 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.53 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1136  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.33 
 
 		 444 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.807965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.76 
 
 		 476 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.49 
 
 		 464 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  28.76 
 
 		 476 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.82 
 
 		 439 aa  95.9  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.55 
 
 		 473 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.9 
 
 		 459 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.84 
 
 		 476 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.95 
 
 		 417 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.38 
 
 		 486 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.05 
 
 		 462 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  39.29 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381977  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  39.91 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.84 
 
 		 326 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.84 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0959  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.17 
 
 		 425 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.09 
 
 		 451 aa  92.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3417  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.47 
 
 		 460 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1084  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.09 
 
 		 460 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.36 
 
 		 457 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.05 
 
 		 509 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21191  ATPase  25.86 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.54 
 
 		 464 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.85 
 
 		 480 aa  90.5  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.82 
 
 		 426 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.33 
 
 		 682 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0164  hypothetical protein  32.45 
 
 		 525 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.156481  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1249  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  26.21 
 
 		 326 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  36.75 
 
 		 371 aa  89.4  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.17 
 
 		 472 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1263  PP-loop  32.51 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>