More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0149 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 376 aa  730    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  77.18 
 
 		 351 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.18 
 
 		 339 aa  216  7e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.19 
 
 		 321 aa  216  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.34 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.94 
 
 		 344 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.55 
 
 		 358 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.25 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  44.28 
 
 		 337 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  45.69 
 
 		 324 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.89 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.33 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.73 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.27 
 
 		 595 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.12 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.99 
 
 		 608 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.18 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.65 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.5 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.33 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.76 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.77 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.62 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.08 
 
 		 312 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  49.33 
 
 		 320 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.33 
 
 		 320 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01210  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.63 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.3 
 
 		 317 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.84 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2989  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  56.44 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.11 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.25 
 
 		 455 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.01 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.65 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  51.09 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.86 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.61 
 
 		 470 aa  149  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  48.82 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.65 
 
 		 469 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.33 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.51 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.7 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.48 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.02 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  57.22 
 
 		 330 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  35.1 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.77 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.58 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.41 
 
 		 326 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  33.75 
 
 		 682 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.87 
 
 		 509 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.67 
 
 		 457 aa  120  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.64 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.96 
 
 		 676 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.62 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  28.94 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.09 
 
 		 480 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  33.09 
 
 		 470 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.17 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  35.49 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.73 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.46 
 
 		 464 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.95 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.46 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.33 
 
 		 324 aa  112  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  37.8 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.86 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  31.4 
 
 		 476 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  36.02 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.8 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.83 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.89 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.43 
 
 		 476 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.59 
 
 		 470 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265542  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.43 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  30.43 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.63 
 
 		 436 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.934648 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  33.73 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  30.83 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  30.83 
 
 		 476 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.83 
 
 		 476 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.99 
 
 		 464 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.92 
 
 		 476 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0957  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32 
 
 		 377 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  31.56 
 
 		 476 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  31.56 
 
 		 476 aa  106  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  33.67 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2413  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.2 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  32.72 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.44 
 
 		 524 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.27 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4841  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.57 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0339142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.43 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.51 
 
 		 342 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.56 
 
 		 426 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.16 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.56 
 
 		 433 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.23 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000332242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>