More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4862 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  100 
 
 		 320 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 		 320 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  99.06 
 
 		 320 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  71.56 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  67.5 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  67.9 
 
 		 323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  60.36 
 
 		 324 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  61.82 
 
 		 317 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  58.54 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  61.96 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  54.19 
 
 		 341 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.04 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.11 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.21 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.33 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  50 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.23 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.33 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  52.16 
 
 		 335 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  47.63 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.27 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.02 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.57 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.13 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.71 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.83 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.31 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.61 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 		 608 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.13 
 
 		 595 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.36 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.39 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.79 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.74 
 
 		 470 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  34.87 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.23 
 
 		 336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  34.29 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.01 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  33.66 
 
 		 336 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17771  ATPase  32.86 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0884418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  39.62 
 
 		 442 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.3 
 
 		 468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.2 
 
 		 455 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.24 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.27 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.33 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  35.67 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.44 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0175  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  35.64 
 
 		 535 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01210  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.7 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.67 
 
 		 426 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  39.34 
 
 		 326 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.08 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.62 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21191  ATPase  28.47 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1249  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.18 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.04 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.04 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.86 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  36.4 
 
 		 445 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.72 
 
 		 440 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.31 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  28.12 
 
 		 476 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  28.12 
 
 		 476 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  34.87 
 
 		 444 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.84 
 
 		 476 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  31.84 
 
 		 476 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.8 
 
 		 476 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0164  hypothetical protein  32.99 
 
 		 525 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.156481  unclonable  0.00000174204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.52 
 
 		 476 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.27 
 
 		 439 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.71 
 
 		 476 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.32 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.19 
 
 		 417 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  30.33 
 
 		 342 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1551  cell cycle protein mesJ, putative  39.3 
 
 		 455 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.96 
 
 		 509 aa  92.4  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  31.02 
 
 		 476 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2962  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.31 
 
 		 448 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.52 
 
 		 476 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.52 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 		 682 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  31.02 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.77 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  35.66 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002764  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.29 
 
 		 436 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01389  cell cycle protein MesJ  31.02 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.683525  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.49 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3147  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.17 
 
 		 442 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.02 
 
 		 476 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1478  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.26 
 
 		 418 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.43 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1031  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.7 
 
 		 451 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3417  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.7 
 
 		 460 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1842  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.12 
 
 		 445 aa  89.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.2555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1084  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.7 
 
 		 460 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0959  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.21 
 
 		 425 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  29.73 
 
 		 431 aa  89.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.14 
 
 		 472 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.51 
 
 		 464 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>