More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_01210 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_01210  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
394 aa  727    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0149  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  53.25 
 
 
376 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.62 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8428  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.71 
 
 
358 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  50.61 
 
 
344 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  47.84 
 
 
334 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.5 
 
 
339 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.13 
 
 
321 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3449  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.99 
 
 
325 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.29 
 
 
364 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.24 
 
 
388 aa  156  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.77 
 
 
333 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9177  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  48.58 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113469  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.31 
 
 
335 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5378  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.64 
 
 
323 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35710  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.77 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.743005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5162  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.05 
 
 
320 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.540091  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1134  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.15 
 
 
372 aa  138  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4020  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.66 
 
 
317 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1411  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.02 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.21 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4776  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  43.09 
 
 
320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4862  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.09 
 
 
320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.43837  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24800  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.76 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 
608 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2897  helix-turn-helix, Fis-type  45.55 
 
 
324 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
595 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0831  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.5 
 
 
344 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.209005  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0614  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.96 
 
 
341 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0202  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.55 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.135787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.4 
 
 
471 aa  119  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.34 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0625  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  45.74 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2989  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.46 
 
 
384 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0700  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  48.81 
 
 
330 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1088  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  38.51 
 
 
487 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00200666  normal  0.0296865 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.25 
 
 
439 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13656  cell cycle protein mesJ  42.12 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0912729  decreased coverage  0.0000749619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.01 
 
 
325 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  49.77 
 
 
308 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.955861  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  29.05 
 
 
342 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0580  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  37.04 
 
 
430 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0306545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1125  PP-loop  37.28 
 
 
484 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00891393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17280  hypothetical protein  41.01 
 
 
442 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1627  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.5 
 
 
335 aa  106  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0555  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.82 
 
 
312 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.644059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.7 
 
 
468 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.96 
 
 
336 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0529  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.51 
 
 
324 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  39.55 
 
 
464 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1352  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.86 
 
 
320 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.64 
 
 
485 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  40.41 
 
 
524 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.61 
 
 
335 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.379803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00186  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.73 
 
 
432 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4939  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.33 
 
 
308 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.457595 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00185  hypothetical protein  36.73 
 
 
432 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.434611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0192  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.61 
 
 
432 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0199  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.28 
 
 
432 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  31.49 
 
 
476 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0190  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.12 
 
 
432 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.22 
 
 
326 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3415  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.16 
 
 
432 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.52 
 
 
476 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.36 
 
 
472 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37 
 
 
431 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0181  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.56 
 
 
432 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3472  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.56 
 
 
432 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878016  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0726  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.53 
 
 
426 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.238503  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3547  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.86 
 
 
427 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3082  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.33 
 
 
368 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1118  hypothetical protein  32.3 
 
 
442 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  28.83 
 
 
449 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.99 
 
 
476 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.25 
 
 
345 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1645  cell cycle protein MesJ  32.97 
 
 
464 aa  99.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1501  hypothetical protein  40.93 
 
 
439 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  32 
 
 
470 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.83 
 
 
449 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4065  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.68 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422892 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.54 
 
 
324 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.16 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0818  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.76 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00477647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.85 
 
 
509 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2886  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.95 
 
 
496 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664509  normal  0.0502291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.22 
 
 
476 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1466  Fis family transcriptional regulator  32.95 
 
 
476 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25 
 
 
306 aa  97.1  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1360  PP-loop  38.12 
 
 
445 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.45 
 
 
457 aa  97.1  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.16 
 
 
326 aa  96.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
682 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1497  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.56 
 
 
491 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.02 
 
 
480 aa  96.3  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.15 
 
 
470 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.5 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3765  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.41 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000300868  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.49 
 
 
442 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2692  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.94 
 
 
465 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000485637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.74 
 
 
326 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>