More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3843 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  100 
 
 		 451 aa  935    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  65.43 
 
 		 451 aa  615  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  63.66 
 
 		 452 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  63.88 
 
 		 452 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  63.44 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  63.22 
 
 		 451 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  63.22 
 
 		 451 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  44.54 
 
 		 551 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43938  predicted protein  34.24 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.270818  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  33.03 
 
 		 482 aa  256  7e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  27.23 
 
 		 473 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63421  Cytochrome P450 51 (CYPLI) (P450-LIA1) (Sterol 14-alpha demethylase) (Lanosterol 14-alpha demethylase) (P450-14DM)  28.48 
 
 		 526 aa  187  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.195375  normal  0.579386 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08283  14-alpha sterol demethylase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96W77]  27.31 
 
 		 526 aa  186  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00402354  normal  0.130811 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01901  Cytochrome P450 sterol 14 alpha-demethylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P462]  27.19 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00300  sterol 14-demethylase, putative  27.12 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  25.55 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  26.08 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  26.65 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  23.9 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  23.7 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  24.94 
 
 		 454 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  24.64 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  23.46 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  26.79 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  25.07 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  25 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  25.36 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  25.17 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  26.18 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  23.52 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  24.72 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  23.72 
 
 		 444 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  22.17 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  24.17 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  23.7 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  23.18 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  25.15 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  23.1 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  30.47 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  23.93 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  23.93 
 
 		 497 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  23.3 
 
 		 493 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  25.84 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  24.48 
 
 		 445 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  23.67 
 
 		 485 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  23.67 
 
 		 485 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  23.67 
 
 		 485 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  26.17 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  29.91 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  22.43 
 
 		 1053 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  26.48 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  25.16 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  20.39 
 
 		 455 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  25.82 
 
 		 1064 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  30.68 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  24.11 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  24.13 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  24.13 
 
 		 480 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  24.16 
 
 		 476 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  30.61 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  26 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  25.52 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  23.96 
 
 		 484 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  25.81 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  28.85 
 
 		 1365 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  24.47 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  29.46 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7149  P-450 monooxygenase  31.16 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  26.78 
 
 		 495 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  25.64 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  23.79 
 
 		 1072 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  23.44 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  27.59 
 
 		 461 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  25.66 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  28.45 
 
 		 452 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  23.31 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  22.62 
 
 		 441 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  28.33 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  22.94 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  28.81 
 
 		 452 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  26.92 
 
 		 563 aa  98.6  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  25.23 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  28.45 
 
 		 769 aa  97.8  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  28.57 
 
 		 459 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  27.47 
 
 		 453 aa  97.4  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  23.43 
 
 		 466 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  23.56 
 
 		 1075 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  27.47 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  24.28 
 
 		 450 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  23.8 
 
 		 453 aa  96.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  23.82 
 
 		 473 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  31.21 
 
 		 452 aa  96.3  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  22.32 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  25.23 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  24.05 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  23.97 
 
 		 1055 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  28.64 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  21.98 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  31.15 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  29.14 
 
 		 1373 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>