198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3708 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  100 
 
 		 449 aa  893    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  52.97 
 
 		 220 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  49.55 
 
 		 256 aa  204  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  50.47 
 
 		 232 aa  204  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  32.73 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  47.93 
 
 		 219 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  48.39 
 
 		 304 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  49.32 
 
 		 273 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  51.76 
 
 		 222 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  48.4 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  48.86 
 
 		 273 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  48.86 
 
 		 273 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  49.75 
 
 		 222 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  48.58 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  43.16 
 
 		 243 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  42.47 
 
 		 239 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  42.2 
 
 		 223 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  38.39 
 
 		 231 aa  156  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  43.07 
 
 		 225 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  43.07 
 
 		 225 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  37.21 
 
 		 532 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  49.08 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  40.55 
 
 		 327 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  45.09 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  37.73 
 
 		 218 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  39.37 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  37.27 
 
 		 218 aa  141  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  35.34 
 
 		 251 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  35.45 
 
 		 221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  38.54 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  38.54 
 
 		 229 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  45.18 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  48.8 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  50.68 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  45.56 
 
 		 289 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  44.85 
 
 		 338 aa  118  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  39.52 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  38.04 
 
 		 384 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  41.18 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  35.79 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  38.32 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  35.79 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  35.79 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  43.45 
 
 		 689 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  37.99 
 
 		 528 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  40.12 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  38.67 
 
 		 722 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  39.64 
 
 		 437 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  38.95 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  37 
 
 		 675 aa  98.2  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  34.39 
 
 		 202 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  32.84 
 
 		 227 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  38.37 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  35.45 
 
 		 209 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.91 
 
 		 590 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  32.95 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  35.33 
 
 		 191 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  29 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  35.33 
 
 		 191 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  34.18 
 
 		 432 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  31.98 
 
 		 216 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  35.47 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  35.8 
 
 		 192 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  32.24 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  30 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  28.04 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  32.62 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  25.4 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  25.4 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  32.98 
 
 		 222 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  31.58 
 
 		 191 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0119  stress protein  37.58 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  32.05 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  29.7 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  31.33 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  32.62 
 
 		 191 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  31.33 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  32.85 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  28.95 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0946  tellurium resistance protein, putative  29.34 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  32.47 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  32.47 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  32.47 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  32.47 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  32.47 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  32.67 
 
 		 192 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  32.47 
 
 		 192 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  29.63 
 
 		 206 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  32 
 
 		 192 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  31.37 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  33.77 
 
 		 191 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  33.78 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  32.05 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  32.05 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  24.6 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  28.67 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  29.41 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  30.77 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.941733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>