90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3178 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3178  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  100 
 
 		 224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0553  hypothetical protein  55.77 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.981391  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0575  hypothetical protein  55.77 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  hitchhiker  0.00774359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0563  hypothetical protein  55.77 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0723  hypothetical protein  54.59 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0182  hypothetical protein  54.19 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3442  hypothetical protein  56.04 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10426  hypothetical protein  47.87 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.393398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  45.15 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1783  alpha/beta fold family hydrolase  38.92 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4023  alpha/beta fold family hydrolase  42.47 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336562  normal  0.117337 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5935  putative hydrolase protein  37.62 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636652  normal  0.167622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1086  putative hydrolase protein  40 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2029  dienelactone hydrolase  37.37 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0251509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44320  hypothetical protein  37.98 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3866  dienelactone hydrolase  43.29 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.708353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1786  dienelactone hydrolase  39.77 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000570181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0359  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  44.1 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7072  putative hydrolase protein  38.86 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00102074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4300  hypothetical protein  39.46 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0262079  normal  0.176496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20020  hypothetical protein  36.46 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2202  hypothetical protein  37.63 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.101227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0877  hypothetical protein  35.33 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000539419  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3772  hypothetical protein  36.23 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0542  hydrolase with alpha/beta-hydrolase fold  34.48 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.52739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02565  predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  34.94 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3074  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  43.12 
 
 		 187 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  decreased coverage  0.0000000220174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4096  hypothetical protein  39.64 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1828  hypothetical protein  32.3 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0958  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.16 
 
 		 185 aa  92  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.800343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4010  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  36.99 
 
 		 210 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0201366  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004251  alpha/beta hydrolase  29.89 
 
 		 207 aa  91.7  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000929244  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1152  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.426204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3412  hypothetical protein  29.9 
 
 		 262 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16635  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3497  hypothetical protein  31.79 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.427254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01184  hypothetical protein  33.78 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4249  hypothetical protein  31.58 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3568  hypothetical protein  33.7 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2598  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  34.76 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000600311  normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3815  hypothetical protein  31.88 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.949374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2005  hypothetical protein  32.2 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2472  hypothetical protein  28.41 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1700  hypothetical protein  36.7 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1705  hypothetical protein  36.08 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0382179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2428  hypothetical protein  32.57 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.781961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5819  hypothetical protein  29.2 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7505  hypothetical protein  39.57 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19031  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.9 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30750  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0543148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  34.04 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2427  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  36.67 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00151914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3543  hypothetical protein  29.33 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4921  hypothetical protein  35.77 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000793472  hitchhiker  0.00000470517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2794  hypothetical protein  33.14 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00486686  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5559  hypothetical protein  31.12 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0499  hypothetical protein  33.14 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1390  hypothetical protein  32.73 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6032  hypothetical protein  31.25 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1351  hypothetical protein  32.73 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2476  hypothetical protein  34.88 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2723  hypothetical protein  33.14 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147001  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0532  hypothetical protein  31.98 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0527  hypothetical protein  31.4 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.872907  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1365  hypothetical protein  31.17 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.159458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3715  hypothetical protein  37.68 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1283  hypothetical protein  32.12 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0971816  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1534  hypothetical protein  31.76 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0960  hypothetical protein  36.26 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796959  normal  0.0488805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1145  hypothetical protein  31.31 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2995  hypothetical protein  30.54 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  hitchhiker  0.00000185469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3769  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  35.23 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6294  hypothetical protein  37.11 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2763  dienelactone hydrolase  28.22 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.545156  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2235  putative hydrolase protein  24.59 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3321  dienelactone hydrolase  28.48 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206123  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  23.22 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2782  hypothetical protein  24.3 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0438432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2564  hypothetical protein  27.09 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  32.2 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  35.25 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  26.57 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  33.9 
 
 		 295 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3083  hypothetical protein  28.06 
 
 		 204 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3470  dienelactone hydrolase  28.86 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00399877  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.29 
 
 		 572 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.393632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2983  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  30.2 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3001  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  35.24 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.044134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  30.73 
 
 		 276 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>