88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1534 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1534  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2794  hypothetical protein  87.91 
 
 		 223 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00486686  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2723  hypothetical protein  87.44 
 
 		 223 aa  387  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147001  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2893  hypothetical protein  84.65 
 
 		 223 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000793472  hitchhiker  0.00000470517 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1390  hypothetical protein  75.24 
 
 		 214 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1351  hypothetical protein  75.24 
 
 		 214 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1365  hypothetical protein  75.12 
 
 		 214 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.159458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1283  hypothetical protein  74.63 
 
 		 224 aa  333  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0971816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2995  hypothetical protein  74.27 
 
 		 214 aa  333  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  hitchhiker  0.00000185469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3321  dienelactone hydrolase  54.98 
 
 		 224 aa  247  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206123  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2564  hypothetical protein  57.6 
 
 		 238 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3470  dienelactone hydrolase  56.4 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00399877  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2782  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  231  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0438432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2763  dienelactone hydrolase  54.63 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.545156  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2983  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  55.84 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2428  hypothetical protein  50.74 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.781961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004251  alpha/beta hydrolase  46.41 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000929244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01184  hypothetical protein  45.45 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3543  hypothetical protein  44.5 
 
 		 236 aa  167  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02565  predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  43.65 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19031  esterase/lipase/thioesterase family protein  43.08 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0542  hydrolase with alpha/beta-hydrolase fold  41.75 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.52739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2005  hypothetical protein  40.5 
 
 		 330 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3412  hypothetical protein  39.15 
 
 		 262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16635  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2202  hypothetical protein  41.92 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.101227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2598  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  38.19 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000600311  normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1828  hypothetical protein  40.8 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4249  hypothetical protein  38.46 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1619  hypothetical protein  38.46 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3568  hypothetical protein  39.41 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1783  alpha/beta fold family hydrolase  40.58 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44320  hypothetical protein  40.78 
 
 		 210 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3772  hypothetical protein  40.4 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3815  hypothetical protein  38.46 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.949374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0958  esterase/lipase/thioesterase family protein  40.36 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.800343  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4300  hypothetical protein  38.69 
 
 		 213 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0262079  normal  0.176496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1152  hypothetical protein  36 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.426204 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5935  putative hydrolase protein  38.65 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636652  normal  0.167622 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7072  putative hydrolase protein  40 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00102074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1086  putative hydrolase protein  37.62 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0877  hypothetical protein  36.92 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000539419  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2235  putative hydrolase protein  32.56 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1786  dienelactone hydrolase  31.16 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000570181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1145  hypothetical protein  36.17 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5819  hypothetical protein  33.49 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0960  hypothetical protein  33.67 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796959  normal  0.0488805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3769  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  33.17 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0527  hypothetical protein  33.01 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.872907  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2029  dienelactone hydrolase  31.47 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0251509  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0532  hypothetical protein  33.01 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0499  hypothetical protein  32.35 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146604  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3497  hypothetical protein  30.69 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.427254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7505  hypothetical protein  32.49 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6032  hypothetical protein  33.82 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2472  hypothetical protein  33.71 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3083  hypothetical protein  35.17 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0723  hypothetical protein  28.07 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5559  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3442  hypothetical protein  29.63 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  26.98 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3178  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  31.76 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0359  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  34.01 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0553  hypothetical protein  27.61 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.981391  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0563  hypothetical protein  27.61 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0575  hypothetical protein  27.61 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  hitchhiker  0.00774359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2476  hypothetical protein  32.12 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  28.48 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4096  hypothetical protein  31.13 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1705  hypothetical protein  32.08 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0382179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10426  hypothetical protein  25.31 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.393398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30750  hypothetical protein  29.17 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0543148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3001  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  29.88 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.044134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3074  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  31.72 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  decreased coverage  0.0000000220174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0182  hypothetical protein  25.9 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3866  dienelactone hydrolase  29.61 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.708353 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2865  hypothetical protein  25.23 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6294  hypothetical protein  35.11 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2672  hypothetical protein  25.23 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0230759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2624  alpha/beta hydrolase  25.23 
 
 		 251 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000020158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2870  hypothetical protein  25.23 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000300623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1918  alpha/beta hydrolase  27.45 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2593  alpha/beta hydrolase  25.49 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00594196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2913  hypothetical protein  26.13 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.504664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2896  hypothetical protein  25.23 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000115341  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2205  hypothetical protein  23.94 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108131  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  28.1 
 
 		 618 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2881  hypothetical protein  26.47 
 
 		 234 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>