68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4010 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4010  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  100 
 
 
210 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0201366  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1700  hypothetical protein  74.49 
 
 
199 aa  260  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2427  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  67.19 
 
 
204 aa  241  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00151914  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4096  hypothetical protein  61.42 
 
 
217 aa  210  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3715  hypothetical protein  60.3 
 
 
241 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30750  hypothetical protein  49.49 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0543148  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6294  hypothetical protein  50.76 
 
 
204 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1705  hypothetical protein  41.45 
 
 
220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0382179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3001  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  47.06 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.044134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4921  hypothetical protein  46.27 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2476  hypothetical protein  42.26 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3178  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  36.99 
 
 
224 aa  91.7  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0960  hypothetical protein  43.18 
 
 
284 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796959  normal  0.0488805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3769  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  37.95 
 
 
261 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.200411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0359  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  41.07 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0553  hypothetical protein  35.29 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.981391  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3772  hypothetical protein  33.13 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0575  hypothetical protein  35.29 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  hitchhiker  0.00774359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0563  hypothetical protein  35.29 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7072  putative hydrolase protein  33.51 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00102074  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44320  hypothetical protein  33.13 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4023  alpha/beta fold family hydrolase  37.7 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336562  normal  0.117337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20020  hypothetical protein  31.4 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5935  putative hydrolase protein  35.23 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636652  normal  0.167622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0182  hypothetical protein  32.53 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01184  hypothetical protein  28.74 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0877  hypothetical protein  32.54 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000539419  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004251  alpha/beta hydrolase  27.54 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000929244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1828  hypothetical protein  33.13 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02565  predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  28.82 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0723  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3866  dienelactone hydrolase  38.78 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.708353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3412  hypothetical protein  32.02 
 
 
262 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16635  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1783  alpha/beta fold family hydrolase  28.65 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4300  hypothetical protein  30.65 
 
 
213 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0262079  normal  0.176496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3442  hypothetical protein  33.17 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7505  hypothetical protein  35.04 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  35.1 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2598  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  30.18 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000600311  normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4249  hypothetical protein  30.56 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3497  hypothetical protein  31.56 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.427254  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2202  hypothetical protein  27.84 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.101227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3568  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1152  hypothetical protein  27.66 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.426204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3815  hypothetical protein  31.33 
 
 
231 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.949374  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2005  hypothetical protein  30.36 
 
 
330 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1619  hypothetical protein  30.94 
 
 
230 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0828333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2029  dienelactone hydrolase  31.51 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0251509  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6032  hypothetical protein  32.93 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1786  dienelactone hydrolase  28.26 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000570181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2472  hypothetical protein  28.74 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5559  hypothetical protein  34.18 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19031  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.76 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10426  hypothetical protein  29.48 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.393398  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  28.14 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1086  putative hydrolase protein  31.93 
 
 
234 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3074  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  36.23 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  decreased coverage  0.0000000220174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3543  hypothetical protein  26.2 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5819  hypothetical protein  32.28 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2235  putative hydrolase protein  29.46 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0542  hydrolase with alpha/beta-hydrolase fold  29.51 
 
 
214 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.52739  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0499  hypothetical protein  37.19 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146604  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0958  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.75 
 
 
185 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.800343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0527  hypothetical protein  37.84 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.872907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0532  hypothetical protein  37.84 
 
 
202 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1145  hypothetical protein  28.99 
 
 
209 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2763  dienelactone hydrolase  27.12 
 
 
240 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.545156  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3083  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>