More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2531 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2531  luciferase-like protein  100 
 
 
330 aa  674    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2017  Luciferase-like monooxygenase  74.16 
 
 
330 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00175263  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  27 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0849  luciferase family protein  25.83 
 
 
293 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.713393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2334  Luciferase-like monooxygenase  33.46 
 
 
304 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0649051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.03 
 
 
299 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5645  luciferase family protein  30.53 
 
 
284 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4624  luciferase family protein  26.67 
 
 
306 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4027  luciferase family protein  26.04 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.826665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  27.39 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1041  luciferase-like protein  25.29 
 
 
308 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.655824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43560  dimethyl sulfone monooxygenase; SfnG  27.3 
 
 
364 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1057  luciferase family protein  25.29 
 
 
308 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.191696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1069  luciferase family protein  24.71 
 
 
308 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5598  luciferase-like protein  30.09 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  25.21 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6103  luciferase family protein  28.29 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0931091  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4419  Luciferase-like, subgroup  26.21 
 
 
311 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  37.87 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  26.72 
 
 
341 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0547  luciferase family protein  25.87 
 
 
369 aa  86.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  24.48 
 
 
328 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7713  flavin-dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5789  luciferase-like  30.39 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6035  luciferase family protein  30.39 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511066  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6154  luciferase family protein  30.39 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893021  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6634  luciferase family protein  30.39 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5805  luciferase-like monooxygenase  30.39 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.62 
 
 
304 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  23.68 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0878  luciferase family protein  25.9 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213528  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2183  Luciferase-like monooxygenase  28.7 
 
 
289 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1987  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  31.31 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3119  Luciferase-like monooxygenase  30.26 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  25.11 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  30.39 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1154  hypothetical protein  25.44 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  29.96 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  29.32 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  24.39 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  27.95 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  27.01 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  26.55 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13096  hypothetical protein  34.75 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0377667  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  32.86 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1798  luciferase family protein  27.12 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2590  bacterial luciferase family protein  30.28 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2280  alkanesulfonate monooxygenase  26.64 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0834003  normal  0.0110546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.95 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  35.96 
 
 
292 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  23.08 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  25.86 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2400  Luciferase-like monooxygenase  29.86 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1790  luciferase-like monooxygenase  29.29 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1886  luciferase-like  31.78 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.5944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1590  luciferase family protein  29.57 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  26.14 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12710  hypothetical protein  24.56 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1645  luciferase family protein  22.9 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  27.07 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4370  hypothetical protein  26.2 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2699  Luciferase-like monooxygenase  22.92 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00225064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  27.51 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  33.86 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1303  luciferase family protein  26.82 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.520917  normal  0.367866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2765  luciferase family protein  27.94 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.395041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2920  luciferase family protein  23.85 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2703  Luciferase-like monooxygenase  23.34 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.190412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.48 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0329  luciferase-like protein  25.88 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  23.21 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2989  luciferase family protein  26.69 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0339  luciferase family protein  25.88 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.92 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0318  luciferase family protein  25.88 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  37.01 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  24.43 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3538  Luciferase-like, subgroup  29.49 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  33.87 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4430  luciferase-like  24.05 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173582  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5819  luciferase family protein  38.46 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.762331  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1017  luciferase family protein  37.12 
 
 
276 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  24.81 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1250  Luciferase-like monooxygenase  26.85 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.44 
 
 
306 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3478  luciferase family protein  28.89 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0878  luciferase family protein  23.72 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.202777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0838  luciferase family monooxygenase  24.19 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  28.31 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  25.86 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  25.86 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.73 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  25.86 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10958  oxidoreductase  24.84 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.410507 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0929  luciferase family monooxygenase  24.19 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  25.77 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  25.29 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2187  luciferase-like monooxygenase  24.78 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  32.09 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>