More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1789 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.31 
 
 
236 aa  228  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  47.41 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  45.7 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.09 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.75 
 
 
220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.2 
 
 
220 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.58 
 
 
225 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.12 
 
 
225 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 
238 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.84 
 
 
236 aa  102  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  102  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 
238 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  32.98 
 
 
244 aa  89  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.26 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4783  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.61 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.46 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  34.76 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.52 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.32 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.12 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.77 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  34.15 
 
 
261 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0225  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.72 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  34.15 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.62 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  35.62 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  35.62 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2526  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.52 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.43 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258792  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  35.62 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 
807 aa  65.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.17736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  33.13 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.27 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05532  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.93 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0030451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  34.93 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.66 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.107177  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  32.73 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  33.12 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  34.15 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  33.33 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  31.53 
 
 
268 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  32.73 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0094  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.35 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  32.73 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  32.73 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1416  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0164  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.209107  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  30.32 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.47 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.61 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
258 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3329  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
257 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0915  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.17 
 
 
719 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.572647  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0212  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.43 
 
 
250 aa  62.4  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.65 
 
 
657 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2912  enoyl-CoA hydratase  29.27 
 
 
252 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00810936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
259 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.53 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1652  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  31.88 
 
 
715 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.39 
 
 
258 aa  62  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  33.54 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.39 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.36 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  32.04 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.08 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  29.9 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2500  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
288 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.38 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 
258 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.77 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.13 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.95 
 
 
659 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.9 
 
 
258 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3077  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.44 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0504224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3188  enoyl-CoA hydratase  26.21 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.69 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  29.9 
 
 
260 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.3 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08370  short chain enoyl-CoA hydratase  33.53 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0645146  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.41 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  30.14 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10643  enoyl-CoA hydratase  31.29 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000313119  normal  0.0554136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001988  fatty oxidation complex alpha subunit FadB  30.22 
 
 
723 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>