More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0985 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  100 
 
 		 263 aa  528  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  63.82 
 
 		 248 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  61.6 
 
 		 280 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  64.8 
 
 		 271 aa  285  8e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  58.94 
 
 		 271 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  58.02 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  56.92 
 
 		 268 aa  255  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  54.05 
 
 		 303 aa  251  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  48.63 
 
 		 350 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  43.23 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  44.35 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  45.67 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  40.31 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  44.66 
 
 		 309 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  43.68 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  47.66 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  43.53 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  43.3 
 
 		 296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  43.3 
 
 		 296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  43.53 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  43.3 
 
 		 296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  42.58 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.44 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  42.29 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  39.36 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.84 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  42.26 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.26 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  39.26 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  39.26 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  38.84 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  37.24 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  43.53 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  34.58 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1610  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  32.72 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.37 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  35.37 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  29.13 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  31.12 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  38.6 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  33.02 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  28.86 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  30.58 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  36.71 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  35.57 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  36.89 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  32.58 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  31.97 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003570  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  32.91 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  30.04 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  33.62 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1557  ABC transporter-like protein  38.99 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  27.46 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  30.89 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  28.11 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4422  ABC transporter related  40 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50330  iron(III)-siderophore ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219188  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27830  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.13 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  31.36 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  31.36 
 
 		 266 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  27.6 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  32.23 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  33.48 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1531  ABC transporter-related protein  35.18 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.821466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  28.81 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  31.94 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2338  ABC transporter, ATPase subunit  34.78 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  33.75 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2510  ABC transporter related  40.67 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.827702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  33.06 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  25.57 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  35.93 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  30.61 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  28.96 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  28.02 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  30.86 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  31.14 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  28.39 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1605  ABC transporter, ATPase subunit  33.72 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  31.17 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1626  ABC transporter related  35.18 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  33.98 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>