218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3651 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2485  potassium transporter family protein  67.88 
 
 		 605 aa  874    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0372664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3346  potassium uptake protein, Kup system  71.29 
 
 		 610 aa  887    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2224  K potassium transporter  52.24 
 
 		 604 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1714  K potassium transporter  53.48 
 
 		 608 aa  658    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00063361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1173  K potassium transporter  67.33 
 
 		 606 aa  868    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  55.72 
 
 		 603 aa  675    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3225  K potassium transporter  69.47 
 
 		 606 aa  889    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00665518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0038  K+ potassium transporter  70.96 
 
 		 605 aa  876    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0039  K+ potassium transporter  66.5 
 
 		 606 aa  866    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.569614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3121  K potassium transporter  66.5 
 
 		 606 aa  856    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3758  K potassium transporter  97.85 
 
 		 606 aa  1187    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3222  K potassium transporter  79.87 
 
 		 606 aa  1006    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0209954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0532  K potassium transporter  65.68 
 
 		 606 aa  840    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0610  K+ potassium transporter  65.68 
 
 		 605 aa  841    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000434273  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3651  K potassium transporter  100 
 
 		 606 aa  1226    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00232162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4312  K+ potassium transporter  70.81 
 
 		 605 aa  899    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1365  K+ potassium transporter  52.69 
 
 		 597 aa  647    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.790927  normal  0.29009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0881  K+ potassium transporter  49.5 
 
 		 611 aa  615  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.540228  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1248  K potassium transporter  41.19 
 
 		 607 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.935948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  35.97 
 
 		 639 aa  345  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  35.99 
 
 		 653 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  34.98 
 
 		 620 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  35.98 
 
 		 625 aa  335  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  35.06 
 
 		 620 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  34.28 
 
 		 620 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  34.19 
 
 		 620 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  34.66 
 
 		 620 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  35.2 
 
 		 621 aa  333  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  34.6 
 
 		 644 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  34.09 
 
 		 644 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  35.53 
 
 		 634 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  32.48 
 
 		 651 aa  324  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  33.76 
 
 		 627 aa  324  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  35.15 
 
 		 632 aa  323  5e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  35.26 
 
 		 634 aa  323  8e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  34.41 
 
 		 661 aa  323  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  33.33 
 
 		 651 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  34.35 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  33.49 
 
 		 651 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  35.65 
 
 		 670 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  34.78 
 
 		 634 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  34.94 
 
 		 634 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  35.57 
 
 		 671 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  35.41 
 
 		 671 aa  319  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  35.1 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  34.23 
 
 		 622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  34.87 
 
 		 633 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  34.43 
 
 		 622 aa  313  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  34.98 
 
 		 656 aa  313  6.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  33.28 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  33.12 
 
 		 637 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  37.5 
 
 		 640 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  33.28 
 
 		 636 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  33.6 
 
 		 637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  35.3 
 
 		 631 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  33.28 
 
 		 631 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  34.42 
 
 		 624 aa  310  5e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  35.12 
 
 		 630 aa  310  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  35.59 
 
 		 634 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  34.68 
 
 		 633 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  34.04 
 
 		 652 aa  309  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  33.61 
 
 		 648 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  34.41 
 
 		 647 aa  307  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  34.01 
 
 		 622 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  34.01 
 
 		 622 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  34.45 
 
 		 633 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  33.28 
 
 		 622 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  34.23 
 
 		 630 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  35.62 
 
 		 632 aa  306  8.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  35.92 
 
 		 633 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  35.59 
 
 		 622 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  32.96 
 
 		 622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  32.96 
 
 		 622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  33.99 
 
 		 632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  32.15 
 
 		 611 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  37.06 
 
 		 626 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  33.54 
 
 		 638 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  33.54 
 
 		 638 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  34.13 
 
 		 636 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  32.18 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  33.54 
 
 		 688 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  33.39 
 
 		 638 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  33.44 
 
 		 638 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  33.01 
 
 		 632 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  34.53 
 
 		 655 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  33.66 
 
 		 637 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  34.13 
 
 		 622 aa  302  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  35.41 
 
 		 622 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  33.71 
 
 		 633 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  32.6 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  34.19 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  33.94 
 
 		 639 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  32.69 
 
 		 628 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  32.54 
 
 		 622 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  33.18 
 
 		 637 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  32.06 
 
 		 672 aa  301  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  35.16 
 
 		 629 aa  300  4e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  33.33 
 
 		 637 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  35.04 
 
 		 622 aa  300  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  32.91 
 
 		 628 aa  300  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>