More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3621 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  95.69 
 
 		 441 aa  827    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  100 
 
 		 441 aa  886    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  40.8 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  38.21 
 
 		 288 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  38.28 
 
 		 280 aa  186  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  36.71 
 
 		 288 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  37.02 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  37.02 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  38.68 
 
 		 312 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  40.34 
 
 		 291 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  35.56 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  41.4 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  39.58 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  39.22 
 
 		 290 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  41.75 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  40.75 
 
 		 280 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  33.79 
 
 		 292 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  41.78 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  40 
 
 		 290 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  40.99 
 
 		 289 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  39.65 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  39.3 
 
 		 290 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 300 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.19 
 
 		 279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  36.03 
 
 		 278 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  36.03 
 
 		 278 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  36.13 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  35.47 
 
 		 280 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  28.04 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  38.13 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  41.22 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  37.31 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  39.58 
 
 		 291 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  38.43 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  38.16 
 
 		 287 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  35.04 
 
 		 282 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  39.61 
 
 		 312 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  35.38 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  35.38 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  34.24 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  35.82 
 
 		 285 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  35.9 
 
 		 276 aa  153  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  34.84 
 
 		 285 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  34.48 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  38.46 
 
 		 291 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4027  ABC-3 protein  31.37 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  39.72 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  30.82 
 
 		 386 aa  147  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  31.58 
 
 		 285 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  36.4 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  32.62 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  32.04 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  33.81 
 
 		 283 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  36.01 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 		 278 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  36.79 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  28.41 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  34.49 
 
 		 289 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  37.72 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  29.49 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  33.78 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.43 
 
 		 286 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.43 
 
 		 286 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.43 
 
 		 286 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.43 
 
 		 286 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.43 
 
 		 286 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  33.78 
 
 		 294 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0532  hypothetical protein  38.35 
 
 		 269 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.344335  normal  0.741945 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  33.78 
 
 		 294 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  34.11 
 
 		 285 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  35.98 
 
 		 276 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  26.39 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  32.09 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  35.06 
 
 		 285 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 285 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.69 
 
 		 282 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.61 
 
 		 276 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  34.96 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3285  ABC-3 protein  27.71 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.69 
 
 		 282 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.69 
 
 		 282 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.69 
 
 		 282 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  32.29 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  32.73 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.03 
 
 		 297 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  35.06 
 
 		 279 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  32.66 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 290 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.03 
 
 		 297 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 290 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.03 
 
 		 297 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  32.36 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  41.8 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  30.34 
 
 		 282 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>