44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2418 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  94.83 
 
 		 386 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  100 
 
 		 386 aa  747    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  70.54 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  38.58 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  35.63 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  35.7 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  37.41 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  31.61 
 
 		 387 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  36.18 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  36.19 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  36.12 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  35.45 
 
 		 415 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  36.12 
 
 		 415 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  36.12 
 
 		 415 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  33.17 
 
 		 448 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  33.24 
 
 		 414 aa  209  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  34.39 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  35.63 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  35.63 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  33.51 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  35.45 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  36.43 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  35.21 
 
 		 422 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  33.25 
 
 		 420 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  34.22 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  36.03 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  33.95 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  34.37 
 
 		 425 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  33.06 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  33.82 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  31.14 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  32.58 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  34.24 
 
 		 414 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  32.41 
 
 		 376 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  30 
 
 		 410 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  33.08 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  27.08 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  25.82 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  28.07 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  26.79 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.729925 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37056  predicted protein  27.89 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190175  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  27.56 
 
 		 371 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1697  hypothetical protein  23.76 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0567  hypothetical protein  28.39 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.764386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>