More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1824 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0945  amidohydrolase  83.47 
 
 
376 aa  679    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.74089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1824  amidohydrolase  100 
 
 
377 aa  782    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2682  amidohydrolase  73.19 
 
 
376 aa  586  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000743905  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3807  amidohydrolase  70.24 
 
 
376 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.393808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1157  peptidase, M20/M25/M40 family  69.71 
 
 
376 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4083  peptidase, M20/M25/M40 family  69.71 
 
 
376 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4029  M20/M25/M40 family peptidase  68.82 
 
 
376 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.293522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3890  M20/M25/M40 family peptidase  68.9 
 
 
376 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3722  M20/M25/M40 family peptidase  68.9 
 
 
376 aa  556  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3738  M20/M25/M40 family peptidase  68.9 
 
 
376 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4193  M20/M25/M40 family peptidase  68.9 
 
 
376 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3995  peptidase, M20/M25/M40 family  68.9 
 
 
376 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4100  peptidase, M20/M25/M40 family  68.55 
 
 
376 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0323014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2834  amidohydrolase  61.5 
 
 
375 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.132688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1813  aminoacylase/N-acyl-L-amino acid amidohydrolase/hippurate hydrolase  48.38 
 
 
377 aa  375  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0614  amidohydrolase  47.85 
 
 
381 aa  372  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0294  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  46.77 
 
 
376 aa  357  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0669  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  44.29 
 
 
384 aa  332  8e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0773  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  43.4 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.197987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  38.07 
 
 
405 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  37.57 
 
 
405 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  38.03 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  36.73 
 
 
403 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  36.56 
 
 
403 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  38.76 
 
 
393 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  39.89 
 
 
390 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  37.74 
 
 
405 aa  246  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  37.3 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.1 
 
 
387 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0937  peptidase M20D, amidohydrolase  39.43 
 
 
387 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.47047  normal  0.0807888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  38.15 
 
 
390 aa  235  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  38.08 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  37.67 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5516  amidohydrolase  40.11 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3600  peptidase M20D, amidohydrolase  40.11 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4767  amidohydrolase  40.11 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.354968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  37.43 
 
 
400 aa  231  1e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  37.91 
 
 
400 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  36.81 
 
 
394 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  38.97 
 
 
399 aa  230  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  39 
 
 
386 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  37.64 
 
 
395 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  36.78 
 
 
380 aa  229  7e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  35.28 
 
 
415 aa  228  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  36.15 
 
 
398 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  38.82 
 
 
382 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  37.53 
 
 
389 aa  226  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5896  amidohydrolase  38.61 
 
 
395 aa  225  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0480348 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2147  amidohydrolase  37.46 
 
 
398 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  39.07 
 
 
400 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  33.76 
 
 
407 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  36.29 
 
 
388 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0948  peptidase M20D, amidohydrolase  38.67 
 
 
395 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1254  amidohydrolase  35.39 
 
 
404 aa  224  3e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  35.29 
 
 
409 aa  223  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  35.64 
 
 
391 aa  222  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2091  amidohydrolase  36.73 
 
 
373 aa  222  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.29 
 
 
480 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  37.54 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.23 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  37.83 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4834  amidohydrolase  37.19 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0546494  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  37.83 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0220  amidohydrolase  32.79 
 
 
389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  37.19 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  35.43 
 
 
390 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1992  amidohydrolase  36.22 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1044  amidohydrolase  34.08 
 
 
364 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  34.15 
 
 
381 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3681  thermostable carboxypeptidase 1  34.62 
 
 
381 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1219  amidohydrolase  34.06 
 
 
369 aa  220  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2487  amidohydrolase  37.09 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0570  amidohydrolase  38.86 
 
 
392 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  38.04 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17381  zinc metallopeptidase  36.41 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.467436  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  36.1 
 
 
396 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  37.6 
 
 
389 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1161  amidohydrolase  37.46 
 
 
386 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4686  amidohydrolase  37.19 
 
 
385 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.694379  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  36.36 
 
 
390 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  36.46 
 
 
391 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  36.03 
 
 
391 aa  219  7e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  36.49 
 
 
379 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  36.61 
 
 
396 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  35.31 
 
 
393 aa  218  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0081  amidohydrolase  36.8 
 
 
369 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348917  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  37.77 
 
 
399 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  37.76 
 
 
390 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  35.91 
 
 
391 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  36.76 
 
 
408 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3623  amidohydrolase  35.42 
 
 
399 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  35.26 
 
 
387 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  35.16 
 
 
410 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  36.61 
 
 
396 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  36.86 
 
 
389 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  36.68 
 
 
388 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  37.29 
 
 
411 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  35.29 
 
 
381 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  36.41 
 
 
384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  34.64 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>