More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1370 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  100 
 
 
157 aa  327  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  91.67 
 
 
157 aa  301  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  69.87 
 
 
162 aa  239  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  68.59 
 
 
162 aa  237  5e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  68.59 
 
 
162 aa  235  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  64.97 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  65.61 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  65.61 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  62.75 
 
 
152 aa  191  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.14 
 
 
168 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  57.14 
 
 
162 aa  188  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  57.69 
 
 
164 aa  187  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0453  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.13 
 
 
154 aa  186  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  58.71 
 
 
153 aa  185  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  55.77 
 
 
169 aa  185  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  53.55 
 
 
169 aa  183  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  53.9 
 
 
182 aa  177  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  54.9 
 
 
164 aa  177  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  55.19 
 
 
152 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1197  RNA methyltransferase  56 
 
 
164 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188758  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  52.2 
 
 
169 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3293  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  56.38 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.212145  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  54.55 
 
 
209 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  55.77 
 
 
155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2379  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.7 
 
 
158 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00313017  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.29 
 
 
154 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.61 
 
 
156 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2088  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.41 
 
 
154 aa  169  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.227987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0924  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.33 
 
 
158 aa  169  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.73808e-35 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  49.35 
 
 
168 aa  169  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3322  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  55.03 
 
 
158 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000129205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1700  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  52.67 
 
 
157 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000455125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  49.01 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  50 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1452  putative rRNA methylase  52 
 
 
156 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000390375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  51.66 
 
 
153 aa  158  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  50 
 
 
152 aa  158  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  46.75 
 
 
153 aa  152  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  46.75 
 
 
153 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.02 
 
 
172 aa  151  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.44 
 
 
156 aa  148  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.4 
 
 
155 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  42.57 
 
 
159 aa  147  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.16 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2268  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.33 
 
 
152 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00048141  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2205  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  50.33 
 
 
152 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.71 
 
 
159 aa  141  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0834  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  50.68 
 
 
152 aa  141  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0618819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3163  RNA methyltransferase  48.05 
 
 
154 aa  140  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.71 
 
 
152 aa  140  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44 
 
 
153 aa  140  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1004  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.3 
 
 
188 aa  140  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2823  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.02 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00419688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1472  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  44.81 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0119863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1874  RNA methyltransferase TrmH, group 2  52.56 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1528  RNA methyltransferase  46 
 
 
152 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130723  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  43.71 
 
 
149 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  47.02 
 
 
153 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  47.02 
 
 
153 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  52.56 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1687  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.3 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0827  spoU rRNA methylase family protein  43.92 
 
 
151 aa  133  8e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000730061  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1574  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.7 
 
 
154 aa  133  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  43.05 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.06 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  46.98 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2885  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.97 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.938343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03960  hypothetical tRNA/rRNA methyltransferase YibK  46.75 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf364  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  39.62 
 
 
173 aa  131  3e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000276139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.06 
 
 
151 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  42.76 
 
 
148 aa  131  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1130  putative tRNA/rRNA methyltransferase  43.79 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.71 
 
 
151 aa  130  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0238  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.06 
 
 
153 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.460006  normal  0.0379576 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  44.74 
 
 
152 aa  130  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0413  RNA methyltransferase  44.44 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.85413 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1127  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  47.4 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  47.02 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5052  RNA methyltransferase  44.44 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0599206  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  47.1 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0450  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.33 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0364  RNA methyltransferase  38.31 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0637729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1000  tRNA/rRNA methylase  45.81 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0879  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  45.81 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4925  RNA methyltransferase  44.44 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61078  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33322  predicted protein  48.08 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl374  rRNA methyltransferase  36.77 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000924245  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0044  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.62 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2182  RNA methyltransferase TrmH, group 2  46.05 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00014694  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2090  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  48.68 
 
 
153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000512947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0359  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  43.62 
 
 
174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012351  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  42.67 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>