139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3355 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
61 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  85 
 
 
61 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  80 
 
 
64 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0934  4-oxalocrotonate tautomerase  59.02 
 
 
61 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1424  4-oxalocrotonate tautomerase  55.74 
 
 
62 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.738733  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1453  4-oxalocrotonate tautomerase  55.74 
 
 
62 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2780  4-oxalocrotonate tautomerase  48.33 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  49.09 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  49.09 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 
63 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0642  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 
61 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.376579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  49.09 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45 
 
 
63 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45 
 
 
63 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3339  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 
63 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3780  4-oxalocrotonate tautomerase  45 
 
 
63 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00700044  decreased coverage  0.000166532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  45 
 
 
63 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1562  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.67 
 
 
62 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1066  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
61 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000129971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  40.98 
 
 
62 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  39.34 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2185  4-oxalocrotonate tautomerase  43.33 
 
 
61 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0740  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000705367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  44.64 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  42.62 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1138  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412705  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6066  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633472  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
62 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3323  hypothetical protein  37.5 
 
 
71 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237693  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2300  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
64 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
62 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3850  4-oxalocrotonate tautomerase  34.55 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0807  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.986407  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  36.67 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0471  4-oxalocrotonate tautomerase  34.43 
 
 
68 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  37.29 
 
 
62 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  41.82 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  36.51 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1079  4-oxalocrotonate tautomerase  43.64 
 
 
60 aa  50.1  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.222536  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0804  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1084  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00458844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0959  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  40 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.67 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0858  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3369  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000172736  hitchhiker  0.00000000000000934917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4872  4-oxalocrotonate tautomerase  31.67 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00584359  normal  0.808556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2114  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.07 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.36 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.67 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2408  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2957  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426421  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
67 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1481  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
65 aa  47.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0325  putative tautomerase  32.14 
 
 
149 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  42.86 
 
 
71 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0609  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
62 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.869247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
67 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  38.33 
 
 
67 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1317  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.702276  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08790  4-oxalocrotonate tautomerase  37.5 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.86271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0911  4-oxalocrotonate tautomerase  39.29 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43002  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0020  4-oxalocrotonate tautomerase  38.33 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4207  4-oxalocrotonate tautomerase  35.19 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  39.34 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6264  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113457  normal  0.380962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5607  4-oxalocrotonate tautomerase  41.27 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  41.07 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0538  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.04 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>