More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2582 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 443 aa  909    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  68.62 
 
 		 444 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  79.69 
 
 		 454 aa  726    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  68.85 
 
 		 444 aa  633  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  68.85 
 
 		 444 aa  632  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  69.07 
 
 		 444 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  68.62 
 
 		 444 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  68.62 
 
 		 444 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  68.4 
 
 		 444 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  68.62 
 
 		 444 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  68.62 
 
 		 444 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  68.4 
 
 		 444 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  68.62 
 
 		 443 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1730  glutamyl-tRNA reductase  57.01 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.234502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1764  glutamyl-tRNA reductase  57.01 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1236  glutamyl-tRNA reductase  57.38 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  44.81 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  43.76 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  46.5 
 
 		 464 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  43.2 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  42.42 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  45.05 
 
 		 464 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  45.48 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  46.21 
 
 		 434 aa  345  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  42.32 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  43.74 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  45.29 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  43.47 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  42.24 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  45.29 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1703  glutamyl-tRNA reductase  40.23 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  45.2 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  44.68 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  44.95 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  42.79 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  42.59 
 
 		 420 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  41.04 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  40.71 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  40.1 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  39.67 
 
 		 426 aa  309  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  40.24 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  41.45 
 
 		 436 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  43.32 
 
 		 414 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 420 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  38.95 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  38.72 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  38.95 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  38.94 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 418 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  39.16 
 
 		 428 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.01 
 
 		 423 aa  295  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  40.28 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  38.72 
 
 		 425 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  39.56 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  42.15 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  39.43 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  37.69 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  39.01 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  37.83 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2025  glutamyl-tRNA reductase  38.6 
 
 		 450 aa  293  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  41.13 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  39.46 
 
 		 438 aa  290  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  38.16 
 
 		 440 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  39.1 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  37.86 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  37.41 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.59 
 
 		 419 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  38.83 
 
 		 429 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  38.48 
 
 		 419 aa  285  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  38.46 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  39.21 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  40.44 
 
 		 424 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  37.7 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  37.03 
 
 		 455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0548  Glutamyl-tRNA reductase  36.53 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675459  normal  0.566276 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  37.18 
 
 		 432 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  36.58 
 
 		 446 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 		 428 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  37.76 
 
 		 428 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  37.59 
 
 		 432 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  38.71 
 
 		 432 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  38.33 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  39.48 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  38.21 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  39.48 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  41.22 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  36.64 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  42.28 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  42.28 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  39.24 
 
 		 416 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  36.84 
 
 		 436 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>