187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1920 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1920  protein of unknown function UPF0005  100 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.049347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2364  protein of unknown function UPF0005  80.6 
 
 		 212 aa  292  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  37.43 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  33.01 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  32.52 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  32.52 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  32.52 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  31.4 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  31.07 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  31.55 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  30.58 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  30.92 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  32.28 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  27.87 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  32.7 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  32.95 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  32.24 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  32.64 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  31.9 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  29.72 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  29.12 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  30.77 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  29.25 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  29.25 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  31.07 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0308  hypothetical protein  35.65 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1882  integral membrane protein  35.65 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.302191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  34.15 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  34.15 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  30.46 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  30.46 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  36.51 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  32.03 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  28.33 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  30.35 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  30.5 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  31.87 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  36 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  29.85 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  30.08 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  36.22 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  36.22 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  30.64 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  31.67 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  32.65 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  30.64 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  29.21 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  29.19 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  29.19 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  29.24 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  30.3 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  30.06 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  29.19 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  30.47 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  28.65 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  35.71 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2268  hypothetical protein  31.11 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.476385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  30.16 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  29.92 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  28.96 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  31.58 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  35.46 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  31.69 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  30.47 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  28.82 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  32.92 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  34.65 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  32.54 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  34.13 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  27.06 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  32.54 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  29.53 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  30.86 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  32.65 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  28.42 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  26.03 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  34.19 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  27.62 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  30.65 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  32.37 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  29.75 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  27.87 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  32.14 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  28.7 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  32.54 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  30.92 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  32.89 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  28.21 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  30.4 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  27.06 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  34.48 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  29.53 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  30.4 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  31.28 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>