228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0424 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  100 
 
 
217 aa  423  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2364  protein of unknown function UPF0005  40 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1920  protein of unknown function UPF0005  37.43 
 
 
210 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.049347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  34.22 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  34.22 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  31.53 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  34.22 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  34.88 
 
 
219 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  33.8 
 
 
219 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  33.03 
 
 
219 aa  88.2  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  33.8 
 
 
219 aa  88.2  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  33.79 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  32.89 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  35.48 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3069  hypothetical protein  37.2 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0838324  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  33.78 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  32.42 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  32.56 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2776  hypothetical protein  32.13 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2350  hypothetical protein  29.95 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0554095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  30.7 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4627  hypothetical protein  32.26 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000408248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3316  hypothetical protein  34.15 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2042  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1437  protein of unknown function UPF0005  33.33 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  32.49 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0260  protein of unknown function UPF0005  32.26 
 
 
259 aa  71.6  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0529527  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  29.3 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  32.2 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  37.24 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3056  hypothetical protein  29.15 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2573  hypothetical protein  30.59 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0057629  decreased coverage  0.000137367 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  29.91 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  33.76 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  31.48 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  30.14 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  32.96 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  33.33 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1802  protein of unknown function UPF0005  30.3 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1349  hypothetical protein  32.11 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  28.9 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1839  hypothetical protein  32.11 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0058  hypothetical protein  32.11 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1111  hypothetical protein  32.11 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2359  hypothetical protein  32.11 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2230  hypothetical protein  32.11 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2194  hypothetical protein  32.11 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.259485  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2232  hypothetical protein  32.11 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  27.27 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  29.95 
 
 
232 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1210  hypothetical protein  29.03 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5117  hypothetical protein  30.88 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0409876  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  31.2 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  31.67 
 
 
274 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1146  protein of unknown function UPF0005  30.41 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39216  normal  0.517284 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  30.65 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  27.68 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  30.97 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1727  hypothetical protein  31.8 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1840  hypothetical protein  31.34 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339326 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  31.03 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  31.03 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6263  hypothetical protein  31.34 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1754  hypothetical protein  31.8 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1816  hypothetical protein  31.34 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1459  hypothetical protein  31.34 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  32.43 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1054  protein of unknown function UPF0005  30.73 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698213  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1294  hypothetical protein  27.95 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000365925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  33.55 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  33.86 
 
 
283 aa  63.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2091  hypothetical protein  28.31 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  34.27 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2825  hypothetical protein  30.3 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  29.72 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  33.82 
 
 
256 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  27.23 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  27.23 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2215  hypothetical protein  26.46 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000153024  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  29.89 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  30.64 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  33.86 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2111  hypothetical protein  27.98 
 
 
235 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.312383  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  31.11 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  33.57 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  31.5 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  31.08 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  27.59 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  30.41 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  30.23 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  30.46 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  35.29 
 
 
242 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1424  hypothetical protein  29.28 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170635  normal  0.0981664 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  30.46 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2545  protein of unknown function UPF0005  28.44 
 
 
232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0069764  hitchhiker  0.00953127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  31.31 
 
 
255 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1590  hypothetical protein  28.44 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  35.25 
 
 
256 aa  58.9  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  27.57 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>