66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1878 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1878  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  326  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000380113  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2649  TPR repeat-containing protein  42.04 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2967  TPR domain-containing protein  42.04 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.142892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2974  TPR domain protein  42.04 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2720  TPR domain-containing protein  41.4 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2927  TPR domain protein  41.4 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4835500000000002e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2928  TPR domain-containing protein  41.4 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2725  TPR repeat-containing protein  41.14 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000242715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2671  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2937  TPR domain protein  40.13 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2308  TPR domain protein  40.13 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0457067  hitchhiker  0.00000000000588055 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1903  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3497  hypothetical protein  36.67 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1257  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3143  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1374  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 157 aa  90.5  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.719868  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01390  hypothetical protein  33.83 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4040  hypothetical protein  34.59 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0640845  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12640  hypothetical protein  35.11 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.80444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2938  hypothetical protein  34.43 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00841158  hitchhiker  0.000372001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  29.01 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3883  hypothetical protein  27.86 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.95 
 
 		 566 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  25.77 
 
 		 653 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 568 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  33.07 
 
 		 573 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.86 
 
 		 292 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 		 420 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 		 420 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 420 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 420 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  36.08 
 
 		 420 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  36.08 
 
 		 420 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  36.08 
 
 		 420 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 573 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 		 572 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.8 
 
 		 572 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.93 
 
 		 626 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.93 
 
 		 626 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  34.69 
 
 		 420 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.93 
 
 		 614 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.93 
 
 		 614 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 614 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 614 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 614 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.23 
 
 		 573 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 		 1067 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 420 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  34.69 
 
 		 420 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 420 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 409 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 520 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 612 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  32.53 
 
 		 392 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 544 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 2262 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.13 
 
 		 626 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 636 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 543 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 222 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0449  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.36 
 
 		 405 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 409 aa  40.8  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  31.87 
 
 		 708 aa  40.8  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1550 aa  40.8  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.23 
 
 		 267 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>