More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1656 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1656  response regulator receiver protein  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.72 
 
 		 226 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  67.41 
 
 		 227 aa  193  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  67.41 
 
 		 227 aa  193  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  63.83 
 
 		 225 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  63.83 
 
 		 225 aa  190  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  65.93 
 
 		 225 aa  189  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  61.7 
 
 		 225 aa  188  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  63.7 
 
 		 225 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  63.12 
 
 		 225 aa  188  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  60.99 
 
 		 225 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  61.7 
 
 		 225 aa  188  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  60.99 
 
 		 225 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  60.99 
 
 		 225 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  65.93 
 
 		 224 aa  186  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  60.74 
 
 		 223 aa  181  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  60.28 
 
 		 223 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  60.28 
 
 		 223 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4716  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 223 aa  178  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0623  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 223 aa  178  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 223 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 223 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  58.87 
 
 		 223 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  58.87 
 
 		 223 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 223 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  58.87 
 
 		 223 aa  178  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C61  DNA-binding response regulator  58.39 
 
 		 222 aa  158  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.47 
 
 		 225 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 		 229 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  52.42 
 
 		 124 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  51.56 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  51.56 
 
 		 223 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  51.22 
 
 		 245 aa  131  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  51.22 
 
 		 245 aa  131  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 225 aa  130  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.86 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.39 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  50 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 246 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  50 
 
 		 223 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 223 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.74 
 
 		 223 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 235 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  44.53 
 
 		 234 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  44.53 
 
 		 234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 224 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.53 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.86 
 
 		 230 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  50.41 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  52.21 
 
 		 231 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 234 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  49.61 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.86 
 
 		 237 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 225 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  47.86 
 
 		 231 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 233 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 233 aa  124  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 233 aa  124  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  50 
 
 		 233 aa  124  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 233 aa  124  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  50.41 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2286  response regulator receiver protein  50 
 
 		 263 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000997036 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 230 aa  123  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  47.01 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 233 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 232 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 232 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  49.14 
 
 		 233 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.56 
 
 		 228 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 233 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  42.41 
 
 		 232 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 233 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  48.48 
 
 		 224 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 228 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  51.28 
 
 		 240 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  48.33 
 
 		 226 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 230 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 234 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  49.14 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 233 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  50.42 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  121  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  48.28 
 
 		 232 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.28 
 
 		 235 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  45.86 
 
 		 222 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  50 
 
 		 227 aa  121  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>