More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1175 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  92.59 
 
 		 243 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  69.29 
 
 		 241 aa  359  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  69.71 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  69.71 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  69.71 
 
 		 241 aa  357  7e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  70.54 
 
 		 246 aa  345  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  69.71 
 
 		 241 aa  342  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  68.86 
 
 		 228 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  46.06 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  44.4 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.19 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0844  transcriptional regulator, putative  31.96 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  29.96 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.78 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  26.78 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  29.54 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.39 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  30.74 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.19 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  25.88 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  24.68 
 
 		 235 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 252 aa  91.7  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 285 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 244 aa  89  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.38 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  27.19 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>