289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3208 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  79.74 
 
 		 154 aa  268  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  75.82 
 
 		 153 aa  244  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  69.93 
 
 		 154 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  69.28 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  64.71 
 
 		 152 aa  190  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  58.82 
 
 		 153 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  45.16 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  40.38 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  39.87 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  42.31 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  40.38 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  43.04 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  37.82 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  37.74 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  39.74 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  33.99 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  39.74 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  33.99 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  39.35 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  41.03 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  39.87 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  36.13 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  35.85 
 
 		 160 aa  103  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  41.18 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  39.47 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  38.06 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  42.58 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  37.34 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  37.01 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  37.01 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  41.94 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  36.71 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  37.42 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  33.95 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  40.65 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  34.18 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  37.42 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  41.94 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  36.77 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>