218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3758 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2485  potassium transporter family protein  68.05 
 
 
605 aa  877    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0372664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3346  potassium uptake protein, Kup system  71.62 
 
 
610 aa  890    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2224  K potassium transporter  52.4 
 
 
604 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3225  K potassium transporter  69.97 
 
 
606 aa  890    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00665518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  55.39 
 
 
603 aa  674    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3222  K potassium transporter  80.03 
 
 
606 aa  1008    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0209954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0038  K+ potassium transporter  70.79 
 
 
605 aa  874    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0039  K+ potassium transporter  66.5 
 
 
606 aa  868    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.569614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1173  K potassium transporter  67.33 
 
 
606 aa  865    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0610  K+ potassium transporter  66.34 
 
 
605 aa  847    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000434273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1714  K potassium transporter  53.81 
 
 
608 aa  660    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00063361  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3758  K potassium transporter  100 
 
 
606 aa  1226    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0532  K potassium transporter  65.84 
 
 
606 aa  839    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4312  K+ potassium transporter  71.07 
 
 
605 aa  902    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3651  K potassium transporter  97.85 
 
 
606 aa  1187    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00232162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3121  K potassium transporter  66.5 
 
 
606 aa  853    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1365  K+ potassium transporter  53.03 
 
 
597 aa  650    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.790927  normal  0.29009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0881  K+ potassium transporter  50.17 
 
 
611 aa  621  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.540228  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1248  K potassium transporter  41.95 
 
 
607 aa  472  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.935948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  35.53 
 
 
639 aa  343  8e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  34.98 
 
 
620 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  36.11 
 
 
621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  35.66 
 
 
625 aa  336  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  35.39 
 
 
620 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  34.19 
 
 
620 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  34.67 
 
 
620 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  34.66 
 
 
620 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  35.67 
 
 
653 aa  334  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  33.7 
 
 
627 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  34.89 
 
 
661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  34.65 
 
 
644 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  33.93 
 
 
644 aa  326  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  32.64 
 
 
651 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  33.66 
 
 
651 aa  323  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  35.21 
 
 
634 aa  323  5e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  33.82 
 
 
651 aa  323  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  35.74 
 
 
634 aa  323  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  35.9 
 
 
634 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  34.77 
 
 
622 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  34.03 
 
 
614 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  35.53 
 
 
632 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  34.94 
 
 
634 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  37.36 
 
 
671 aa  316  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  37.84 
 
 
670 aa  316  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  35.41 
 
 
671 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  37.32 
 
 
640 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  35.11 
 
 
624 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  33.44 
 
 
637 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  35.36 
 
 
656 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  34.74 
 
 
622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  33.28 
 
 
636 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  35.83 
 
 
634 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  34.73 
 
 
622 aa  313  7.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  35.35 
 
 
633 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  35.62 
 
 
631 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  35.06 
 
 
633 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  34.53 
 
 
652 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  33.86 
 
 
637 aa  311  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  34.64 
 
 
622 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  34.57 
 
 
647 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  35.47 
 
 
630 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  34.31 
 
 
632 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  32.74 
 
 
611 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  34.82 
 
 
630 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  37.5 
 
 
626 aa  309  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  35.11 
 
 
633 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  37.06 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  33.76 
 
 
632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  37.06 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  33.44 
 
 
631 aa  308  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  34.82 
 
 
636 aa  308  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  36.1 
 
 
633 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  33.44 
 
 
631 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  33.7 
 
 
638 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  33.44 
 
 
648 aa  307  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  33.7 
 
 
688 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  33.7 
 
 
638 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  33.54 
 
 
638 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  34.12 
 
 
639 aa  306  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  36.59 
 
 
622 aa  306  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  33.12 
 
 
622 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  33.66 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  33.44 
 
 
638 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  33.12 
 
 
622 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  34.19 
 
 
647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  34.83 
 
 
629 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  34.99 
 
 
629 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  36.15 
 
 
632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  37.28 
 
 
622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  34.43 
 
 
622 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  33.39 
 
 
637 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  33.54 
 
 
637 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  32.03 
 
 
628 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  34.96 
 
 
622 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  34.85 
 
 
655 aa  303  5.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  33.17 
 
 
632 aa  303  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  34.29 
 
 
622 aa  303  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  33.66 
 
 
633 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  32.7 
 
 
628 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  32.42 
 
 
628 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>