More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2797 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  100 
 
 
286 aa  578  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  92.88 
 
 
284 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  53.38 
 
 
276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  44.89 
 
 
288 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  44.87 
 
 
274 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.78 
 
 
273 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  44.28 
 
 
277 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  44.28 
 
 
275 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  33.21 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  37.93 
 
 
377 aa  92.4  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  37.93 
 
 
343 aa  89.4  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  40.43 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
282 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  43.69 
 
 
382 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  39.81 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  35.57 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  33.06 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  40.82 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  43.88 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.64 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  33.09 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  36 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.23 
 
 
559 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  31.28 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  37.78 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.59 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  30.35 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  36 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  37 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  43.52 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0069  phosphoethanolamine N-methyltransferase  29.24 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0516193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1568  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.24 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.24 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.731828  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  34.15 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.13 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  35.09 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  37.29 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.26 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.26 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.53 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  40 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  38.05 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.13 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  37.5 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  37.61 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  38.18 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.48 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
254 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.08 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
242 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.79 
 
 
251 aa  67  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  40 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.39 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  38.53 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.72 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.59 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.4 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0512  hypothetical protein  36.73 
 
 
207 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.96 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3202  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  35.9 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.4 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.04 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>