More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5917 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  58.74 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  55.98 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 220 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  37.9 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5342  hypothetical protein  49 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.22 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.2 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  27.44 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.06 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.33 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  22.83 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  34.96 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.39 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.05 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  34.53 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.33 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.44 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.44 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.13 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  26.83 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.83 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  26.83 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  25.65 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.25 
 
 		 452 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.56 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 199 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.02 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.49 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.49 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.05 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  27.15 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  29.19 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  23.77 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  23.03 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 		 448 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.29 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.49 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2822  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.72 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 445 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.11 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  29.11 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.58 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.58 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  23.53 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  22.64 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.12 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25.61 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>