297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5352 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  100 
 
 		 268 aa  530  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  52.26 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  35.59 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  38.22 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2323  hypothetical protein  39.57 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.569628  normal  0.0283599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0200  hypothetical protein  34.38 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  31.36 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0541  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.73 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.73 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.73 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.73 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.73 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0450  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.12 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.12 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.01 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.02 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.46 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  34.33 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  30.83 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.59 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.34 
 
 		 328 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.64 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  30.43 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  29.29 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 		 335 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  26.9 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  23.24 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  23.24 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 209 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 337 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  32.43 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  34.46 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  22.22 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.52 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  36.75 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  29.71 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1449  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  30 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  31.16 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.83 
 
 		 274 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  32 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  29.1 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  28.99 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.41 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 224 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 264 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 323 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>