More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5341 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  55.01 
 
 		 860 aa  789    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  72.41 
 
 		 889 aa  1184    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.813754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  51.56 
 
 		 830 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5341  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 915 aa  1794    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  51.79 
 
 		 830 aa  738    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2121  AMP-dependent synthetase and ligase  51.37 
 
 		 868 aa  790    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2855  AMP-dependent synthetase and ligase  50.06 
 
 		 829 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4142  AMP-dependent synthetase and ligase  49.64 
 
 		 860 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  50.35 
 
 		 831 aa  703    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  51.79 
 
 		 830 aa  738    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  50.24 
 
 		 862 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  45.87 
 
 		 841 aa  575  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 887 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  39.87 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2621  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 453 aa  287  5e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2843  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 		 459 aa  259  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0145799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3177  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 471 aa  204  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 497 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 		 534 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 		 530 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 		 523 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 523 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 418 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  27.29 
 
 		 923 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 520 aa  154  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 526 aa  149  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 		 517 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 514 aa  144  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 521 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  26.93 
 
 		 520 aa  142  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  26.25 
 
 		 923 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  27.87 
 
 		 923 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.14 
 
 		 492 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.76 
 
 		 491 aa  131  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 533 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 523 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 515 aa  119  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 523 aa  119  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 529 aa  117  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 531 aa  115  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.71 
 
 		 530 aa  114  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 538 aa  111  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 512 aa  111  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 519 aa  111  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 512 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 545 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 510 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  31.44 
 
 		 8211 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 526 aa  109  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 553 aa  108  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  29.09 
 
 		 2614 aa  108  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 505 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0174  amino acid adenylation  28.98 
 
 		 1332 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 505 aa  107  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.08 
 
 		 532 aa  106  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 505 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  28.4 
 
 		 3710 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 535 aa  106  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 535 aa  106  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 608 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 535 aa  106  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 509 aa  106  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 535 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.71 
 
 		 514 aa  105  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 520 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 691 aa  103  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.88 
 
 		 539 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 503 aa  102  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 538 aa  101  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  28.25 
 
 		 11233 aa  101  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 513 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 511 aa  100  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.88 
 
 		 529 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 529 aa  99.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 527 aa  99.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 522 aa  98.2  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.9 
 
 		 536 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 522 aa  98.6  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 585 aa  98.2  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.35 
 
 		 510 aa  97.8  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 522 aa  98.2  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.73 
 
 		 510 aa  97.8  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  27.32 
 
 		 6999 aa  97.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.73 
 
 		 510 aa  97.8  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.73 
 
 		 510 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.92 
 
 		 510 aa  97.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.35 
 
 		 510 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 565 aa  97.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.82 
 
 		 510 aa  97.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.12 
 
 		 510 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.31 
 
 		 510 aa  96.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 548 aa  96.3  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.25 
 
 		 510 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  28.42 
 
 		 558 aa  95.5  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 529 aa  95.5  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 525 aa  94.4  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0888  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.96 
 
 		 1152 aa  94  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3780  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 		 577 aa  94  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.97917 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  31.99 
 
 		 522 aa  94.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>