39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4904 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4904  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  325  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.097022  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5432  protein of unknown function DUF1707  49.56 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00776452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3666  TM2 domain containing protein  48.25 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1899  TM2 domain-containing protein  57.65 
 
 		 155 aa  87.8  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.47053  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11631  hypothetical protein  52.75 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0708972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3046  TM2 domain-containing protein  54.76 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3105  TM2 domain-containing protein  54.76 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3062  TM2 domain-containing protein  54.76 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0882033  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2315  hypothetical protein  38.97 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3595  TM2 domain-containing protein  44.23 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.687188  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1913  TM2 domain-containing protein  54.17 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114845  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1541  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2820  TM2 domain-containing protein  49.45 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1922  TM2 domain-containing protein  51.43 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.134509 
 
 
-
 
NC_002936  DET0230  TM2 domain-containing protein  46.34 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0604  TM2 domain protein  31.75 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35490  predicted membrane protein  39.17 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15340  TM2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 253 aa  62  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17940  predicted membrane protein  46.03 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.300515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3876  TM2 domain containing protein  50 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1399  TM2 domain containing protein  48.21 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452664  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_204  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0125  TM2 domain-containing protein  48.57 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0602  TM2 domain protein  45 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0822  TM2 domain containing protein  35.87 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0591  TM2 domain containing protein  45.95 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000337836  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2746  TM2 domain containing protein  42.42 
 
 		 67 aa  51.2  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000224877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25400  protein of unknown function (DUF1707)  42.86 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.7287 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2756  TM2 domain containing protein  39.39 
 
 		 67 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000265887  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  45.61 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0258  hypothetical protein  43.18 
 
 		 110 aa  48.1  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000028904  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2238  TM2 domain-containing protein  39.29 
 
 		 101 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.540179  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4067  TM2 domain containing protein  43.18 
 
 		 469 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  45.74 
 
 		 406 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0052  hypothetical protein  37.75 
 
 		 210 aa  42.4  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000726443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2984  TM2 domain containing protein  32.56 
 
 		 305 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.39909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  42.86 
 
 		 117 aa  41.6  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>