167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4682 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4682  galactokinase  100 
 
 		 424 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  55.05 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  38.38 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  41.94 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  37.78 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  36.52 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  39.55 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  38.89 
 
 		 384 aa  242  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  39.16 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  35.64 
 
 		 386 aa  239  9e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  35.61 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  41.62 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  41.07 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  38.48 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  36.41 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  36.41 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  36.41 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  36.41 
 
 		 382 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  35.7 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  36.25 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  36.25 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  36.25 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  36.25 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  36.41 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  39.39 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  36.25 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  35.99 
 
 		 382 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  35.38 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  39.65 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  36.46 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  34.72 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  35.62 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  40.27 
 
 		 359 aa  223  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  35.1 
 
 		 381 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  34.75 
 
 		 381 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  33.42 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  35.4 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  35.35 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  35.48 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  42.43 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  40.16 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  32 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  35.09 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  36.6 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  37.5 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  35.1 
 
 		 381 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  35.34 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  35.22 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  35.34 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  42.2 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  35.34 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  36.68 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  35.34 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  36.68 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  36.68 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  37.8 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  35.92 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  34.38 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  32.41 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  37.53 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  35.29 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  43.77 
 
 		 389 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  37.09 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  34.26 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  38.12 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  37.87 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  34.4 
 
 		 404 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  43.57 
 
 		 363 aa  206  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  41.67 
 
 		 349 aa  206  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  33.16 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  31.46 
 
 		 388 aa  203  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  38.63 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  32.18 
 
 		 392 aa  202  9e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  38.12 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  37.85 
 
 		 357 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  35.13 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  30.61 
 
 		 387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  32.12 
 
 		 389 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  34.97 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  31.12 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  39.24 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  39.73 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  33.8 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  31.97 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  33.78 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  37.22 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  38.21 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  41.29 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  38.72 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  33.5 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  32.55 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  31.9 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  36.39 
 
 		 414 aa  193  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  42.35 
 
 		 403 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  41.22 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  35.33 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  41.05 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  28.46 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  31.32 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  42.68 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>