More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4477 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4477  cytochrome P450  100 
 
 
420 aa  852    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752604  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.46 
 
 
405 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  34.51 
 
 
429 aa  189  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.18 
 
 
410 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.62 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.3 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.28 
 
 
399 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  34.59 
 
 
423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  42.05 
 
 
423 aa  182  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  33.58 
 
 
410 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.98 
 
 
420 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  35.38 
 
 
404 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.9 
 
 
401 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.77 
 
 
402 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.46 
 
 
417 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.41 
 
 
394 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  38.15 
 
 
402 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.38 
 
 
417 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  33.67 
 
 
405 aa  177  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  39.87 
 
 
420 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.45 
 
 
407 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  32.35 
 
 
399 aa  176  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  33.02 
 
 
396 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  33.59 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  30.81 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.79 
 
 
411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.83 
 
 
426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  40.72 
 
 
421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.71 
 
 
412 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  35.71 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  33.23 
 
 
407 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.1 
 
 
417 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  33.95 
 
 
407 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.25 
 
 
399 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  34 
 
 
406 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  34.6 
 
 
401 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  33.69 
 
 
407 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  33.69 
 
 
407 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  31.91 
 
 
421 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  33.25 
 
 
408 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.05 
 
 
402 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  38.98 
 
 
406 aa  170  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.98 
 
 
418 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  32.53 
 
 
401 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  37.38 
 
 
398 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  35.62 
 
 
402 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  36.84 
 
 
400 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.33 
 
 
412 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  38.18 
 
 
357 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  35.88 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  36.75 
 
 
367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  34.47 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  35.27 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.62 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  28.6 
 
 
415 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.1 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  36.02 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  33.8 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  36.83 
 
 
401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.39 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  33.63 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  32.43 
 
 
423 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  32.78 
 
 
418 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  30.51 
 
 
417 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  36.67 
 
 
395 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  36.68 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  36.02 
 
 
450 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30.88 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.18 
 
 
395 aa  163  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  32.93 
 
 
419 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1607  cytochrome P450  31.03 
 
 
414 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798045  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.76 
 
 
405 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  37.24 
 
 
399 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.16 
 
 
411 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.19 
 
 
392 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  34.81 
 
 
431 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  35.53 
 
 
399 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.88 
 
 
411 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  37.46 
 
 
406 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  37.46 
 
 
406 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  37.46 
 
 
406 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  35.87 
 
 
373 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.44 
 
 
409 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  33.52 
 
 
399 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  33.76 
 
 
398 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  35.59 
 
 
400 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.11 
 
 
408 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  32.16 
 
 
399 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.99 
 
 
411 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  33.22 
 
 
405 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  34.58 
 
 
447 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  29.08 
 
 
408 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  34.58 
 
 
447 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  37.38 
 
 
399 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  31.93 
 
 
405 aa  160  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.24 
 
 
407 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.67 
 
 
388 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.77 
 
 
412 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  35.31 
 
 
414 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  35.16 
 
 
407 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>