More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2690 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  100 
 
 
340 aa  683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  51.31 
 
 
348 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2020  putative oxidoreductase  49.71 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0300  Luciferase-like monooxygenase  57.24 
 
 
364 aa  311  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  49.85 
 
 
348 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  49.85 
 
 
353 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11391  oxidoreductase  55.16 
 
 
340 aa  309  5e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  49.85 
 
 
353 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4326  putative oxidoreductase  49.06 
 
 
337 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  49.85 
 
 
352 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  45.81 
 
 
335 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1615  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  47.54 
 
 
349 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  41.89 
 
 
341 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  41.64 
 
 
342 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0941  luciferase-like protein  44.72 
 
 
341 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3109  luciferase family protein  45.27 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1527  hypothetical protein  42.81 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186055  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1557  hypothetical protein  42.5 
 
 
327 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1581  hypothetical protein  42.5 
 
 
327 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4500  hypothetical protein  45.17 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139462  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1819  hypothetical protein  46.91 
 
 
329 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3961  putative F420-dependent oxidoreductase  46.4 
 
 
333 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  35.86 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0868  hypothetical protein  35.5 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0862  hypothetical protein  35.18 
 
 
338 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0879  hypothetical protein  35.18 
 
 
338 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1168  luciferase family protein  34.85 
 
 
337 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5162  luciferase family protein  34.6 
 
 
341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  32.99 
 
 
349 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  33.33 
 
 
349 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  32.06 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  33.94 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  33.94 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.94 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  32.35 
 
 
344 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.81 
 
 
333 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.98 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  34.04 
 
 
346 aa  95.9  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  27.89 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  33.75 
 
 
309 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  30.63 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8964  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.73 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  31.06 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  28.71 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  31.75 
 
 
283 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  29.01 
 
 
345 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  26.59 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  28.38 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  26.59 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
346 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  28.38 
 
 
343 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  26.59 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  28.67 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  29.55 
 
 
309 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  29.02 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.44 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  28.81 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.85 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  27.67 
 
 
343 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  28.67 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  26.48 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4174  putative N5, N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  26.19 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.754635  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  30.74 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  34.58 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  27.57 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  33.19 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  28.99 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  31.93 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.17 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.14 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  31.38 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
347 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.28 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  32.84 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.1 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  34.48 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.52 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  28.11 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  35.34 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  31.69 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  26.89 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  30.74 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.86 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  26.09 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  28.47 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  25.63 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  25.63 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  25.63 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4402  luciferase family protein  28.69 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952289  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  28.52 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.62 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  26.47 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.69 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>