186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2122 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  68.28 
 
 		 245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  52.13 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  52.41 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  46.6 
 
 		 244 aa  177  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  46.35 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  46.07 
 
 		 370 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  49.71 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  41.4 
 
 		 188 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1930  protein of unknown function DUF218  47.02 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000562665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  34 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  35.62 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  33.5 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  33.51 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  29.53 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  29.58 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  29.38 
 
 		 192 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  29.02 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  38.85 
 
 		 181 aa  95.9  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  35 
 
 		 176 aa  95.5  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  24.87 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  35.26 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  35.26 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  28.43 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  30.38 
 
 		 195 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  28.66 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  28.66 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  28.66 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  27.93 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  26.97 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  27.22 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  28.03 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  38.22 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  27.39 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  27.39 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  27.39 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  27.39 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  27.39 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  30.34 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  36.77 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  34.52 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.64 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  31.48 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  32.95 
 
 		 193 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  35.97 
 
 		 333 aa  72  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  34.69 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  33.56 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  27.03 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  31.36 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  33.58 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  33.58 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  27.13 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  33.58 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  33.58 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  31.1 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  32.85 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  31.17 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  31.01 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  29.92 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  29.92 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  35.14 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  31.39 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  29.93 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  24.4 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  28.87 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  26.47 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  25.69 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  23.21 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  37.29 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  35 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  27.82 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  27.82 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  27.82 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  27.82 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  26.52 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  25.2 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  26.85 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  27.82 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  27.82 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  30.08 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  29.59 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  26.52 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  25.76 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  26.88 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  30.58 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  30.58 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.41 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  26.52 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.41 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  37.12 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  31.97 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  30.58 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  29.05 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>