More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1937 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  100 
 
 
199 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3011  adenylate kinase  76.53 
 
 
204 aa  275  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  51.31 
 
 
193 aa  184  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  50.83 
 
 
189 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  50.53 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  50.53 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  50 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  47.67 
 
 
192 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  49.72 
 
 
191 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  46.67 
 
 
194 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  46.67 
 
 
194 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  50.54 
 
 
184 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  46.15 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  45.75 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  42.93 
 
 
214 aa  165  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  46.56 
 
 
205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  45.67 
 
 
217 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  49.17 
 
 
211 aa  164  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  50.77 
 
 
204 aa  164  9e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  44.91 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  43.26 
 
 
216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  47.31 
 
 
191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  47.8 
 
 
187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  45.6 
 
 
193 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  47.12 
 
 
217 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  45.54 
 
 
217 aa  160  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  44.65 
 
 
217 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  42.2 
 
 
217 aa  160  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.23 
 
 
217 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  46.39 
 
 
193 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  45.36 
 
 
360 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  45.21 
 
 
192 aa  160  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  46.15 
 
 
217 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.33 
 
 
211 aa  159  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  44.68 
 
 
192 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  44.79 
 
 
199 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  38.89 
 
 
215 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.88 
 
 
423 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  46.63 
 
 
217 aa  158  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  46.63 
 
 
217 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  45.3 
 
 
205 aa  159  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  41.71 
 
 
213 aa  157  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  46.7 
 
 
187 aa  156  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  41.86 
 
 
216 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  44.79 
 
 
199 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  42.33 
 
 
216 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  46.15 
 
 
187 aa  155  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  43.68 
 
 
195 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.86 
 
 
216 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.86 
 
 
216 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  41.01 
 
 
216 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  44.9 
 
 
195 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  45.95 
 
 
183 aa  155  4e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  42.47 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  44.79 
 
 
200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  45.21 
 
 
367 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  39.44 
 
 
214 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  44.23 
 
 
219 aa  153  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  39.62 
 
 
215 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  41.31 
 
 
217 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  46.63 
 
 
217 aa  153  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  43.55 
 
 
186 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  42.42 
 
 
213 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  42.11 
 
 
214 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  45.6 
 
 
181 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  45.56 
 
 
183 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  48.07 
 
 
181 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  48.07 
 
 
181 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  43.39 
 
 
197 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  44.2 
 
 
197 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  48.07 
 
 
181 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1234  adenylate kinase  43.06 
 
 
215 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  44.33 
 
 
341 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  39.72 
 
 
213 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  45.74 
 
 
184 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  39.13 
 
 
185 aa  151  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  47.15 
 
 
192 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  46.94 
 
 
205 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  45.3 
 
 
182 aa  151  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  45.11 
 
 
195 aa  151  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  41.86 
 
 
214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  43.23 
 
 
200 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  43.85 
 
 
184 aa  151  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  42.7 
 
 
195 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  42.93 
 
 
206 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  43 
 
 
208 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  46.96 
 
 
181 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  40.74 
 
 
309 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  42.13 
 
 
216 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  41.63 
 
 
214 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  38.6 
 
 
215 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  39.07 
 
 
216 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  47.51 
 
 
183 aa  148  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  44.32 
 
 
186 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  39.35 
 
 
217 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  44.62 
 
 
182 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  39.71 
 
 
214 aa  147  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  41.67 
 
 
192 aa  147  8e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  40.93 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  39.45 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>