31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4419 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1024    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0153  major facilitator transporter  74.41 
 
 		 598 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0060166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0107  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0413  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0501  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 529 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.406138  decreased coverage  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8089  integral membrane protein  44.14 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0814  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 515 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3931  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34020  arabinose efflux permease family protein  38.77 
 
 		 578 aa  233  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8901  hypothetical protein  40.34 
 
 		 505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5040  major facilitator superfamily transporter  37.71 
 
 		 561 aa  209  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1238  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 663 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0828  major facilitator superfamily transporter  36.92 
 
 		 560 aa  203  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4729  hypothetical protein  38.99 
 
 		 548 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10893  transmembrane protein  35.94 
 
 		 548 aa  196  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0340183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4855  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4472  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 566 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4559  major facilitator superfamily transporter  37.76 
 
 		 566 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.046029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1711  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1448  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0483  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 576 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  26.91 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 445 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  30.59 
 
 		 432 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.88 
 
 		 1829 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>