62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1994 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 259 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11261  hypothetical protein  42.91 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0851453 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  40.59 
 
 		 241 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.2 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45928  predicted protein  35 
 
 		 359 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.178958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.88 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.66 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.79 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  27.11 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.23 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.35 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  27.5 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.66 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4193  ectoine hydroxylase  27.35 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0556414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4259  ectoine hydroxylase  27.35 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104748  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4420  ectoine hydroxylase  27.35 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  29.71 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.12 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.66 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  28.9 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  31.29 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  26.56 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.86 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  38.46 
 
 		 280 aa  52.4  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  29.88 
 
 		 332 aa  52  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.87 
 
 		 320 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  26.23 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  25.11 
 
 		 304 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.07 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.83 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  32.67 
 
 		 289 aa  48.9  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  28.04 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.9 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.32 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  24.24 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.41 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.7 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.73 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  29.22 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3672  ectoine hydroxylase  24.37 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  26.38 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  31.09 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.8 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.93 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.88 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 		 394 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.81 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48742  predicted protein  23.66 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.21 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.85 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0554  hypothetical protein  24.69 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  30.25 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  24.69 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.97 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  22.36 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  24.42 
 
 		 315 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>