More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1579 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  64.78 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  60.08 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  59.83 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  55.36 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  56.64 
 
 		 282 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  56.09 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  52.63 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  49.78 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  52.19 
 
 		 266 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  51.53 
 
 		 410 aa  206  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  48.1 
 
 		 410 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  47.26 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  51.54 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 414 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 420 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 378 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 		 394 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 227 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 411 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.8 
 
 		 382 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 221 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  30.57 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 586 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 226 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 491 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 374 aa  92.8  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 239 aa  92.8  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 430 aa  92  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  32.9 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 476 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 393 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 472 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 236 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 320 aa  89  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.3 
 
 		 809 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 394 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  31.12 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 414 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  27.39 
 
 		 502 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 325 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 386 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  29.2 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 480 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  28.69 
 
 		 476 aa  85.9  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.77 
 
 		 252 aa  85.9  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  30.68 
 
 		 238 aa  85.9  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 334 aa  85.5  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 230 aa  85.5  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  30.34 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  32.74 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.15 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.6 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16881  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  39.87 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  32.34 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>