More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1316 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1316  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  362  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1632  hypothetical protein  69.77 
 
 		 172 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.096808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5198  hypothetical protein  64.97 
 
 		 178 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1075  hypothetical protein  59.88 
 
 		 172 aa  190  9e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3205  hypothetical protein  56.65 
 
 		 174 aa  174  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5983  transferase family protein  56.65 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  47.13 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  46.59 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  44.25 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0976  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.32 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11932  normal  0.0642131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  43.43 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1072  hypothetical protein  43.75 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0856829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  41.99 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  42.86 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  43.43 
 
 		 176 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  41.71 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  44.25 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  42.2 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  45.4 
 
 		 174 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  42.44 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1607  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily  47.14 
 
 		 232 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.78593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  43.56 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2634  hexapaptide repeat-containing transferase  41.24 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.988857  normal  0.429505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3912  hypothetical protein  41.81 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  41.62 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  41.04 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  50.71 
 
 		 234 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  41.92 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  42.51 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  39.43 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1450  hexapaptide repeat-containing transferase  50.77 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.292844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1435  hexapaptide repeat-containing transferase  44.51 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 		 174 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  45.07 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  44.32 
 
 		 177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  46.34 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 		 174 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  43.45 
 
 		 179 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  46.34 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  41.34 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2168  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  45.73 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  47.79 
 
 		 177 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  41.71 
 
 		 174 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  41.38 
 
 		 174 aa  128  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  43.93 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3140  hypothetical protein  42.37 
 
 		 176 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2556  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.88 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.025307  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3937  transferase hexapeptide protein  39.29 
 
 		 175 aa  127  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  41.07 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  38.86 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1577  hexapaptide repeat-containing transferase  39.31 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.447375  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  41.48 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  47.52 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  47.88 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3742  transferase family protein  37.5 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0368075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  43.75 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  40.94 
 
 		 172 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  39.29 
 
 		 172 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  40.23 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  40.46 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  41.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1059  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  39.13 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.95 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4306  carbonic anhydrase  47.83 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  33.14 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.61 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4038  carbonic anhydrase  47.69 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820028  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  38.64 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4076  carbonic anhydrase  47.83 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5226  hypothetical protein  41.24 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592347  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4152  carbonic anhydrase  47.83 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  38.86 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  39.43 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  40.48 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  38.86 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  36.9 
 
 		 171 aa  121  7e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  40.72 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  38.32 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  41.07 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  40.12 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  37.93 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4906  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  51.15 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1008  ferripyochelin-binding protein  40.12 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.251932  hitchhiker  0.000436281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  39.88 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  41.28 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  37.57 
 
 		 174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  37.66 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  40.34 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  36.78 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  39.69 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  38.24 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  39.52 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  36.53 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2573  hexapeptide repeat-containing transferase  36.78 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2627  hexapeptide repeat-containing transferase  36.78 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>