62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1289 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1289  oxidoreductase-like  100 
 
 		 540 aa  1082    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  29.9 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4072  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.946495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3872  oxidoreductase domain protein  26.05 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02345  hypothetical protein  27.71 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  24.7 
 
 		 734 aa  60.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0388  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.702394  normal  0.542029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23420  putative zinc-binding dehydrogenase  27.46 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123826  hitchhiker  0.00977209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1685  alcohol dehydrogenase  22.73 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0808  alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 		 712 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3331  alcohol dehydrogenase  24.81 
 
 		 719 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.127059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1306  oxidoreductase-like  32.21 
 
 		 747 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 		 467 aa  54.3  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3794  zinc-binding alcohol dehydrogenase  22.41 
 
 		 719 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4033  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 		 699 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0424149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.32 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 		 350 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.17 
 
 		 346 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  31.93 
 
 		 346 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1674  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 		 311 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0873607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  28.7 
 
 		 493 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 358 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0600  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 427 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  36.9 
 
 		 350 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 361 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 356 aa  47.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3862  dehydrogenase-like protein  37.21 
 
 		 390 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  28.89 
 
 		 337 aa  47  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  39.19 
 
 		 335 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  28.12 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.49 
 
 		 359 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  26.16 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  22.83 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 339 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  41.67 
 
 		 336 aa  45.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 350 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  29.85 
 
 		 352 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  28.11 
 
 		 350 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  33.87 
 
 		 376 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.74 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  25.95 
 
 		 344 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  24.09 
 
 		 374 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.74 
 
 		 356 aa  44.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 349 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2166  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.81218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  36.62 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  24.37 
 
 		 405 aa  44.3  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 		 345 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1819  oxidoreductase domain-containing protein  25 
 
 		 313 aa  44.3  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 495 aa  44.3  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 		 363 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2162  oxidoreductase domain-containing protein  36.52 
 
 		 798 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  27.97 
 
 		 334 aa  43.9  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  24.15 
 
 		 421 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1110  oxidoreductase-like protein  26.45 
 
 		 400 aa  43.5  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00265336  hitchhiker  0.0048453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 341 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>