51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0567 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  100 
 
 		 82 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  54.76 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  74.16 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  49.4 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  47.13 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  46.99 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  50.63 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  55.17 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  49.32 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  46.34 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  50.91 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  54.55 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  44.05 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  41.98 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  34.12 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  43.55 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  35.37 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  35.37 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  47.54 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  43.21 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  61.11 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  35.37 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  47.27 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  47.06 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  55.36 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  42.11 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  36.62 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  53.85 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.67 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  38.03 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  43.64 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  45.28 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  45.28 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  35.14 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  32.05 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  36.51 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  39.44 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  44.64 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>